RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	VMA22	P38784	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	HPA3	P39979	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	CIN1	P40987	1014 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PER33	Q12144	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RAS1	P01119	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MBA1	P38300	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	TEN1	Q07921	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YOR1	YGR281W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PTP2	P29461	750 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MTC2	P34246	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SEA4	P38164	1038 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	ROY1	Q04847	553 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	CDC7	P06243	507 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SCY1	P53009	804 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	HOL1	P53389	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SAM50	P53969	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YLR460C	P54007	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MDM32	Q12171	622 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	NIC96	P34077	839 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MNN2	P38069	597 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PHM8	P40025	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YIL165C	P40446	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	UBX6	P47049	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YHM2	Q04013	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	GSH2	Q08220	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	TAF14	P35189	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MNL1	P38888	796 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
YOR1	YGR281W	VHR1	P40522	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	HXT9	P40885	567 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RSM23	Q01163	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	ACS1	Q01574	713 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PSF1	Q12488	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	URA3	P03962	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YKL075C	P36083	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MRH4	P53166	561 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SAY1	P53324	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	IPI3	P53877	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	IRC19	Q07843	230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	OAC1	P32332	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YRO2	P38079	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	DTR1	P38125	572 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	BMT5	P40493	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	EMC4	P53073	190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	COG1	P53079	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SED5	Q01590	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	CAB5	Q03941	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SMP3	Q04174	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	ASA1	Q06822	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	AIM6	Q07716	390 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	IRC10	Q08118	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	DIT1	P21623	536 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	RIB5	P38145	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	MSC1	Q03104	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	YFT2	Q06676	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	UPC2	Q12151	913 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YOR1	YGR281W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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