RNA–Protein interactions for RNA: YDR062W

LCB2, Transcript of Component of serine palmitoyltransferase, yeast

Gene LCB2, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB2	YDR062W	SEC9	P40357	651 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YJL118W	P47022	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	VPS25	P47142	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	FRE4	P53746	719 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YNL234W	P53857	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	UBX2	Q04228	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	NAT4	Q04751	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BNA5	Q05979	453 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	THI20	Q08224	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	UBA3	Q99344	299 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SKT5	P34226	696 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	CHS7	P38843	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	OTU1	P43558	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	BET5	Q03630	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MDM36	Q06820	579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RAD7	P06779	565 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	CWP1	P28319	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	KRE6	P32486	720 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	FRE2	P36033	711 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MMS21	P38632	267 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	NAS6	P50086	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	KAP114	P53067	1004 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SAM50	P53969	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MSS11	Q03825	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SIA1	Q12212	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
LCB2	YDR062W	MRPL8	P22353	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SPO11	P23179	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ITR1	P30605	584 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ECM15	P35195	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RSM22	P36056	628 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	HOT13	P36078	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SPC34	P36131	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YAR1	P46683	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RRN9	P53437	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YNR048W	P53740	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	GTO3	Q04806	366 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ATG31	Q12421	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	COX2	P00410	251 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RAD3	P06839	778 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	UTR1	P21373	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YCR100C	P25606	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	CYM1	P32898	989 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	COS9	P36034	407 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YKL071W	P36086	256 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	FAA2	P39518	744 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	PRM9	P39551	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SIM1	P40472	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RTS2	P40962	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MRX5	P47007	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	COX16	P47081	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SSN8	P47821	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	TAF6	P53040	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YGR117C	P53270	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ATP23	P53722	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	NCA2	Q12374	616 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YOP1	Q12402	180 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	JIP3	O13555	125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RAD1	P06777	1100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	PDR3	P33200	976 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	YPK3	P38070	525 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	HIS2	P38635	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	BIO4	P53630	237 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	IRC15	Q02733	499 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	IZH1	Q03419	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	GMC2	Q06201	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	AHC1	Q12433	566 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	FAR1	P21268	830 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	MOH1	P38191	138 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCB2	YDR062W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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