RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM23A6NLE4 172 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CIB2O75838 187 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 SDHBP21912 280 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 MYO1EQ12965 1108 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 COL19A1Q14993 1142 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 STXBP2Q15833 593 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF233A6NK53 670 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KRT24Q2M2I5 525 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 RNF208Q9H0X6 261 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 AAASQ9NRG9 546 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DSEQ9UL01 958 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RNF180Q86T96 592 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HELQQ8TDG4 1101 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC77Q9BR77 488 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ACAD9Q9H845 621 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf4Q9NR00 106 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 POTEB3A0JP26 581 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 B4E1Z4 1266 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PYGLP06737 847 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PYGBP11216 843 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 ALCAMQ13740 583 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 POTEBQ6S5H4 581 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TTC39CQ8N584 583 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 PRRX2Q99811 253 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 COX10Q12887 443 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 CCL15Q16663 113 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CHST3Q7LGC8 479 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.76□□□□□ -1.33
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