RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNX1Q13596 522 aa24.59■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.59■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITFG2Q969R8 447 aa24.59■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NR2E1Q9Y466 385 aa24.59■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUP98P52948 1817 aa24.58■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPTORQ8N122 1335 aa24.58■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LBRQ14739 615 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.58■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNAT1P11488 350 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAPAP54920 295 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SBK1Q52WX2 424 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS36Q86VN1 386 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTMR9Q96QG7 549 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf50Q9HD87 102 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNMA3Q9UL41 463 aa24.58■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIP1RO75146 1068 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNH2Q12809 1159 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MFSD5Q6N075 450 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FITM2Q8N6M3 262 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM7Q9C029 511 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASB3Q9Y575 518 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRD1A4D1F6 860 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP2D6P10635 497 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNA11P29992 359 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GBP1P32455 592 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHRNDQ07001 517 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF384Q8TF68 577 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.57■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UCHL3P15374 230 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TFAP4Q01664 338 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CALCRLQ16602 461 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA21Q7Z572 469 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBCKQ8TEA7 893 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB34Q9BZG1 259 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNX24Q9Y343 169 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMCO2A6NFE2 343 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACTN1P12814 892 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLUL1Q15846 466 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JAMLQ86YT9 394 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.56■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASGRF2O14827 1237 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMIM24O75264 130 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP6V1C1P21283 382 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNGA1P29973 690 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NT5C2P49902 561 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDIA5Q14554 519 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM210AQ96ND0 272 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.55■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CALB2P22676 271 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE6BP35913 854 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT79Q5XKE5 535 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLG1Q92896 1179 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CARD9Q9H257 536 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PARP2Q9UGN5 583 aa24.54■■□□□ 1.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.54■■□□□ 1.52
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