RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YDR114C	Q04597	100 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	COG4	Q06096	861 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	VTA1	Q06263	330 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	HIF1	Q12373	385 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	FMP27	Q06179	2628 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	URA4	P20051	364 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	KEG1	P43614	200 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YGR117C	P53270	476 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SED5	Q01590	340 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	API2	Q04413	109 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ARR1	Q06596	294 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YPR063C	Q12160	140 aa		0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	UNG1	P12887	359 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ALG1	P16661	449 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	AAC3	P18238	307 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ANP1	P32629	500 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GPI16	P38875	610 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GGC1	P38988	300 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YFR054C	P43622	192 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	CDH1	P53197	566 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YGR015C	P53208	328 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	APC4	Q04601	652 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	RTN2	Q12443	393 aa		0.19	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	KRE1	P17260	313 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ERG3	P32353	365 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	MCM10	P32354	571 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PRM1	P53835	661 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GMC1	Q04399	608 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PEX30	Q06169	523 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ATP16	Q12165	160 aa		0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	TAO3	P40468	2376 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.17	□□□□□ -2.38	not detected
snR46	snR46	CLB1	P24868	471 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GPX2	P38143	162 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SHE1	P38200	338 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PCL7	P40186	285 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SPO22	P40511	975 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	COS5	P47187	383 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YGL138C	P53122	345 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SLT2	Q00772	484 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GAS2	Q06135	555 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	COS7	Q07788	383 aa		0.17	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GEX1	P25596	615 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YEL043W	P32618	956 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	TIR2	P33890	251 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	MET18	P40469	1032 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	CIN2	P46670	268 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	YJR054W	P47114	497 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	PIB2	P53191	635 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GTO3	Q04806	366 aa		0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	DST1	P07273	309 aa		0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	DAL81	P21657	970 aa		0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YER188W	P40103	239 aa		0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	JJJ1	P53863	590 aa		0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YOP1	Q12402	180 aa		0.15	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.14	□□□□□ -2.39	not detected
snR46	snR46	HEM4	P06174	275 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TFS1	P14306	219 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CTA1	P15202	515 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ROX1	P25042	368 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YCH1	P42937	148 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	NAS6	P50086	228 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CSI1	Q04368	295 aa		0.14	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	SSH4	P32343	579 aa		0.13	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms