RNA–Protein interactions for RNA: YOR369C

RPS12, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS12, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS12	YOR369C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RPB5	P20434	215 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	UTR1	P21373	530 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RAD51	P25454	400 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	STP22	P25604	385 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	PCL2	P25693	308 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YME1	P32795	747 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	PTM1	P32857	523 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	TOD6	P34219	525 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YKL187C	P34231	750 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ASK1	P35734	292 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CBP4	P37267	147 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	FES1	P38260	290 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	EXO84	P38261	753 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YBR220C	P38318	560 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	VRG4	P40107	337 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ALG5	P40350	334 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SDP1	P40479	209 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	HOS4	P40480	1083 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CAF16	P43569	289 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CHA4	P43634	648 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	AAD10	P47182	288 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	DUG3	P53871	357 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YNL058C	P53947	316 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	GIP3	Q03016	1276 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YPL039W	Q03080	316 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ECM11	Q04110	302 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	TAF11	Q04226	346 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	URC2	Q04411	772 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SWF1	Q04629	336 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	UBX3	Q12229	455 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ATG34	Q12292	412 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	NPC2	Q12408	173 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ERP4	Q12450	207 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	DIF1	O13577	133 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YML002W	P0CF17	737 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	NMT1	P14743	455 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SED4	P25365	1065 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	DMC1	P25453	334 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	KAR4	P25583	335 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	MNN2	P38069	597 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CHK1	P38147	527 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CAJ1	P39101	391 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SHO1	P40073	367 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RIC1	P40395	1056 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YIL169C	P40442	995 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YIL012W	P40551	113 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	IDP2	P41939	412 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YFL012W	P43580	148 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	MRPL19	P53875	158 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	PRM15	Q03262	622 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	GIS1	Q03833	894 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YMR027W	Q04371	470 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	TMA10	Q06177	86 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	VAC14	Q06708	880 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YDL121C	Q07541	149 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SRL2	Q12020	392 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	MHF1	Q3E835	90 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SPT3	P06844	337 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected
RPS12	YOR369C	AAC3	P18238	307 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	DBF2	P22204	572 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	SAN1	P22470	610 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	MRPL25	P23369	157 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RAD57	P25301	460 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CTR86	P25355	563 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	EHD3	P28817	500 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	CTS1	P29029	562 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	EMP70	P32802	667 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	PTH2	P34222	208 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	NUP120	P35729	1037 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	YOR062C	P36025	268 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	RKM3	P38222	552 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	TDP1	P38319	544 aa		2.56	□□□□□ -2
RPS12	YOR369C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2

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