RNA–Protein interactions for RNA: YOR367W

SCP1, Transcript of Component of yeast cortical actin cytoskeleton, yeast

Gene SCP1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCP1	YOR367W	SPR6	Q01684	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SIA1	Q12212	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	CRC1	Q12289	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	CSM1	P25651	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	CAB3	P36076	571 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YHR045W	P38775	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	FAA2	P39518	744 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	PCL6	P40038	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	FMC1	P40491	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YIL024C	P40543	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	FMP33	P46998	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	COX16	P47081	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	TAF6	P53040	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	CGR1	P53188	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ESBP6	P53918	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	INP2	Q03824	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	BTS1	Q12051	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ATX2	Q12067	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	POM152	P39685	1337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	RAD7	P06779	565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ACB1	P31787	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SUA5	P32579	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YEF1	P32622	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YKL162C	P36052	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SNM1	P40993	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	BNA6	P43619	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	MRX5	P47007	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SFH5	P47008	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	NAS6	P50086	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	KEL2	P50090	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	KAP114	P53067	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SPP2	Q02521	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YAP7	Q08182	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	MSF1	P08425	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	FAR1	P21268	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ITR1	P30605	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	MST28	P39552	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	RBG1	P39729	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	YER085C	P40058	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	DSE1	P40077	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	AZR1	P50080	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	POP6	P53218	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	ARK1	P53974	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	BET4	Q00618	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	RTT103	Q05543	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	UBA3	Q99344	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCP1	YOR367W	RAD1	P06777	1100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	UTR1	P21373	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YKR015C	P36111	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	IST2	P38250	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	HIS2	P38635	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SBE22	P38814	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YHR182W	P38870	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	FLO5	P38894	1075 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	BIO3	P50277	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	LST7	P53237	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	HER2	Q03557	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GMC2	Q06201	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CTS2	Q06350	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YRM1	Q12340	786 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RBK1	P25332	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	DCC1	P25559	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ERG9	P29704	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SCP1	YOR367W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SCP1	YOR367W	MMS21	P38632	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GEP4	P38812	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	FHL1	P39521	936 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	HAT2	P39984	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MSS2	P40990	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AZF1	P41696	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	KEG1	P43614	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YAR1	P46683	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AVT4	P50944	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TIM21	P53220	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MKC7	P53379	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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