RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W CMC1P36064 111 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ALG5P40350 334 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W BIT61P47041 543 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YGL114WP53134 725 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PIH1P38768 344 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PIG2P40187 538 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YNR068CP53754 272 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W BET4Q00618 327 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ROY1Q04847 553 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W BCP1Q06338 283 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YFH1Q07540 174 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SWT1Q12104 458 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PEX11Q12462 236 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MRPS28P21771 286 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CDC5P32562 705 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RFC5P38251 354 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GAA1P39012 614 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ECM27P47144 725 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MSY1P48527 492 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PEF1P53238 335 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YNR071CP53757 342 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ATG23Q06671 453 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TMA16Q08687 178 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W UIP4Q08926 304 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W THI21Q08975 551 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.66□□□□□ -1.98not detected
SIN3YOL004W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CHS2P14180 963 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GEX1P25596 615 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ERV1P27882 189 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PXL1P36166 706 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GEX2P36173 615 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PMT5P52867 743 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W BOP3P53958 396 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YOL159CQ08300 171 aa2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W REP2P03872 296 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.98not detected
SIN3YOL004W YKL071WP36086 256 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PSD1P39006 500 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YLR345WQ06137 509 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YLR046CQ12253 270 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W BIK1P11709 440 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SIP1P32578 815 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ALG14P38242 237 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SBE22P38814 852 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YER034WP40022 185 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DIA3P52290 468 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W STR3P53101 465 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TRS31Q03337 283 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MCM21Q06675 368 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W NTO1Q12311 748 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W Q0297Q9ZZV8 51 aa2.65□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TDH1P00360 332 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CDC21P06785 304 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MRPL8P22353 238 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PTC6P25646 442 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W GSH1P32477 678 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YME1P32795 747 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W REC114P32841 428 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W IML3P38265 245 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YGP1P38616 354 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YIL086CP40503 102 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SKO1Q02100 647 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YMR130WQ04223 302 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TRM12Q04235 462 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TY1A-DR3Q12441 440 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SRN2Q99176 213 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W DMC1P25453 334 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W HMX1P32339 317 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W HYM1P32464 399 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SOR1P35497 357 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MRPL39P36533 70 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W IME4P41833 600 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PTR3P43606 678 aa2.65□□□□□ -1.99
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