RNA–Protein interactions for RNA: YML007W

YAP1, Transcript of Basic leucine zipper (bZIP) transcription factor, yeast

Gene YAP1, Length 1,953 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YAP1	YML007W	RCY1	P39531	840 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YEL020C	P39994	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MET28	P40573	187 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	CIN1	P40987	1014 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ECL1	P48235	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PFA5	Q03289	374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ARO10	Q06408	635 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	GPI11	Q06636	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SEC2	P17065	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PEX6	P33760	1030 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SEF1	P34228	1148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MTC2	P34246	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SEA4	P38164	1038 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SMK1	P41808	388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SNO3	P43544	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PLM2	Q04383	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	CDA2	Q06703	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	APC2	Q12440	853 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ERD1	P16151	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MEF1	P25039	761 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	RPC82	P32349	654 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	LYP1	P32487	611 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	IDS2	P46958	469 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	CUZ1	P53899	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	HFD1	Q04458	532 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MRX4	Q12467	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	TSC13	Q99190	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	BAR1	P12630	587 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	REC107	P21651	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	GRR1	P24814	1151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ADH7	P25377	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PEP12	P32854	288 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	HCS1	P34243	683 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	TUL1	P36096	758 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	NSG1	P38837	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YJL193W	P39542	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ECM10	P39987	644 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	LAS21	P40367	830 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	NUP57	P48837	541 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	BUR2	Q05949	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ASA1	Q06822	443 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YIM1	P28625	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	TPO5	P36029	618 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	OM14	P38325	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ANS1	P38832	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PZF1	P39933	429 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ILM1	P47155	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YGR168C	P53293	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YSA1	Q01976	231 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	VIK1	Q12045	647 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MDM32	Q12171	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	SFG1	Q12507	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MTR10	Q99189	972 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	CDC9	P04819	755 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	EMP70	P32802	667 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	YPT7	P32939	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
YAP1	YML007W	AGP3	P43548	558 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	ECO1	P43605	281 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	MDE1	P47095	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	COS6	P53344	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	FMP45	Q07651	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YAP1	YML007W	DCI1	Q08558	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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