RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	STD1	Q02794	444 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YPL080C	Q02826	108 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MMT1	Q03218	510 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	API2	Q04413	109 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	OPY2	Q06810	360 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	IMA2	Q08295	589 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HMS1	Q12398	434 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PCL9	Q12477	304 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	POM152	P39685	1337 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FLO11	P08640	1367 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YML133C	Q03099	1374 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YLL067C	Q07888	1374 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YLL066C	Q99208	1374 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CTA1	P15202	515 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MET8	P15807	274 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ALG1	P16661	449 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PPH22	P23595	377 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	OCA4	P25366	362 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TIP20	P33891	701 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GPX2	P38143	162 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RRN10	P38204	145 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ECM8	P38246	354 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YER084W	P40057	128 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CIN2	P46670	268 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YJR054W	P47114	497 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FMS1	P50264	508 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	JJJ1	P53863	590 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YNL095C	P53932	642 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CSI1	Q04368	295 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDR222W	Q04925	415 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YOL029C	Q08187	201 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FEX1	Q08913	375 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FEX2	Q08991	375 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	VAM3	Q12241	283 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	NRG2	P38082	220 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GPI16	P38875	610 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GGC1	P38988	300 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YFR045W	P43617	309 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YFR054C	P43622	192 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	COS5	P47187	383 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YGR117C	P53270	476 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	VTA1	Q06263	330 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	COS7	Q07788	383 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ATP16	Q12165	160 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GCN4	P03069	281 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HEM4	P06174	275 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PHO80	P20052	293 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FAR1	P21268	830 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CLB6	P32943	380 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	COS9	P36034	407 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MED8	P38304	223 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MET18	P40469	1032 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MIG2	P53035	382 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CDH1	P53197	566 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RRN9	P53437	365 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SPR6	Q01684	191 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	UBX2	Q04228	584 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDR114C	Q04597	100 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FSH2	Q05015	223 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ECM19	Q06011	112 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	COG4	Q06096	861 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	DXO1	Q06349	442 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ARR1	Q06596	294 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SIL1	Q08199	421 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YPL264C	Q08980	353 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	URA4	P20051	364 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	INO2	P26798	304 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPB9	P27999	122 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	BRF1	P29056	596 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GPI10	P30777	616 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YKR015C	P36111	568 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	EFM1	P38732	585 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SPO22	P40511	975 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	DAN1	P47178	298 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SLT2	Q00772	484 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ATG16	Q03818	150 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDR018C	Q12185	396 aa		0.04	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	COX3	P00420	269 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CLC1	P17891	233 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	AAC3	P18238	307 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms