RNA–Protein interactions for RNA: YLR132C

USB1, Transcript of Putative phosphodiesterase specific for U6 snRNA 3' end modification, yeastyeast

Gene USB1, Length 873 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1YLR132C ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C PUP2P32379 260 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C MNS1P32906 549 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C YBL028CP38202 106 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C PAC11P40960 533 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C EPL1P43572 832 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C ROG1P53118 685 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C IMA2Q08295 589 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C YOR387CQ08910 206 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C NCA2Q12374 616 aa3.6□□□□□ -1.83
USB1YLR132C MOT1P32333 1867 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C YCL068CP25593 260 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
USB1YLR132C SKN1P33336 771 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C CHK1P38147 527 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C YPI1P43587 155 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C MLC1P53141 149 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C BTN2P53286 410 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C CWC25P53854 179 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C CCE1Q03702 353 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C NDL1Q06568 189 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C SRN2Q99176 213 aa3.59□□□□□ -1.83
USB1YLR132C DAL2P25335 343 aa3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C DOA1P36037 715 aa3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C COX14P39103 70 aa3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YIL029CP40538 142 aa3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C TOS3P43637 560 aa3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C RAX1Q08760 435 aa3.58□□□□□ -1.84
USB1YLR132C NFT1P0CE68 1218 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C JLP2P40206 208 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C ATM1P40416 690 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MTQ1P53944 314 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C SPR6Q01684 191 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C RSA1Q08932 381 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C ERV2Q12284 196 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YRM1Q12340 786 aa3.57□□□□□ -1.84
USB1YLR132C TRP1P00912 224 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C NAM2P11325 894 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PET123P17558 318 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YSC83P32792 385 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C DAD2P36162 133 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MRPL4P36517 319 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C QDR3P38227 689 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C GPI16P38875 610 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MNL1P38888 796 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MAM33P40513 266 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YGR210CP42942 411 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C INM2Q05533 292 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C LOT6Q07923 191 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C TLG2Q08144 397 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C AAD15Q08361 143 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MYO1P08964 1928 aa3.56□□□□□ -1.84
USB1YLR132C NAM9P27929 486 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C POP5P28005 173 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C SKT5P34226 696 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C AVT5P38176 459 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C APE4P38821 490 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C REE1P40893 198 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C RTT102P53330 157 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C NUP116Q02630 1113 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YFH1Q07540 174 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C SKS1Q12505 502 aa3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MSP1P28737 362 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YBR137WP38276 179 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MDE1P47095 244 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YIP5P53108 310 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MTM1P53320 366 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MEH1Q02205 184 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C IPK1Q06667 281 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C FRE6Q12473 712 aa3.54□□□□□ -1.84
USB1YLR132C TPK3P05986 398 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PHO84P25297 587 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C YEF1P32622 495 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C MLH1P38920 769 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PAN6P40459 309 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PRM6Q04705 352 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C ECM7Q06200 448 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C IRC25Q07951 179 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C EAF3Q12432 401 aa3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USB1YLR132C PIS1P06197 220 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USB1YLR132C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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