RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C ECM11Q04110 302 aa2.29□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C LDS2Q08218 356 aa2.29□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C CMK2P22517 447 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C CAB3P36076 571 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C KAP104P38217 918 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C PFF1P38244 976 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C EFM4P40516 257 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C ABM1P47146 123 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C YGL262WP53054 175 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C YGR018CP53211 109 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C APJ1P53940 528 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C VPS9P54787 451 aa2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CSE4YKL049C ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C STE7P06784 515 aa2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YMR010WQ03687 405 aa2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MCH1Q07376 486 aa2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C HMS1Q12398 434 aa2.27□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MMS22Q06164 1454 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MNE1P24720 663 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C GIT1P25346 518 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C DPH2P32461 534 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SOL2P37262 315 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SPP381P38282 291 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MLH1P38920 769 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YIP5P53108 310 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RSC1P53236 928 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C IPK1Q06667 281 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SRN2Q99176 213 aa2.26□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C BMT2P38278 337 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C WSC4P38739 605 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YHR177WP38867 453 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C KEG1P43614 200 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C CIN2P46670 268 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C FLC3P53121 802 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C VHT1P53241 593 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MSC3Q05812 728 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MCT1Q12283 360 aa2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MRPL8P22353 238 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C ECT1P33412 323 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C EBP2P36049 427 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C HEM14P40012 539 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SEC9P40357 651 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C IES4Q08561 116 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SFM1Q12314 213 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C ERP4Q12450 207 aa2.24□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MAS2P11914 482 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MDL1P33310 695 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C PEX22P39718 180 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YFL012WP43580 148 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C CWC22P53333 577 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C VAC7P53950 1165 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YPL107WQ02873 248 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YDR115WQ04598 105 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YLR177WQ06251 628 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C GAT3Q07928 141 aa2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C CHD1P32657 1468 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C HEM4P06174 275 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C ANP1P32629 500 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C PEX5P35056 612 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C CHL4P38907 458 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C EPL1P43572 832 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C MLC1P53141 149 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C FSH2Q05015 223 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C YDL109CQ12103 647 aa2.22□□□□□ -2.05
CSE4YKL049C UFD4P33202 1483 aa2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C ASP3-2P0CX77 362 aa2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C ASP3-3P0CX78 362 aa2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C ASP3-4P0CX79 362 aa2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C ASP3-1P0CZ17 362 aa2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C TAF2P23255 1407 aa2.21□□□□□ -2.06
CSE4YKL049C LDS1P31379 325 aa2.21□□□□□ -2.06
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