RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	YCL002C	P25565	263 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	MSN2	P33748	704 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
RGT1	YKL038W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	BET3	P36149	193 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	HMT1	P38074	348 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	ACO2	P39533	789 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	BAP3	P41815	604 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	COS12	P53053	380 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	LSB1	P53281	241 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YPL067C	Q02754	198 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	ARG7	Q04728	441 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YPR063C	Q12160	140 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RIB3	Q99258	208 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	GMH1	P36125	273 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RAD55	P38953	406 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	NPP2	P39997	493 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SAM50	P53969	484 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RHO4	Q00246	291 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	OST6	Q03723	332 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	PHO92	Q06390	306 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	GRC3	Q07845	632 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	PNS1	Q12412	539 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	MHT1	Q12525	324 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	MHF2	Q3E829	80 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	MDM12	Q92328	271 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	AFI1	Q99222	893 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SNF5	P18480	905 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	AHC2	P25649	128 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SEF1	P34228	1148 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	CSG2	P35206	410 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	FRE2	P36033	711 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YKL162C	P36052	402 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	MRPL15	P36523	253 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	ROT2	P38138	954 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SRO77	P38163	1010 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	AFG3	P39925	761 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	UFD1	P53044	361 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YPL257W	Q08974	193 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	DST1	P07273	309 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SEC62	P21825	274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	IXR1	P33417	597 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YKL069W	P36088	180 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	MUP3	P38734	546 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SNG1	P46950	547 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	KTR6	P54070	446 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	SPR28	Q04921	423 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	HOF1	Q05080	669 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	VAM3	Q12241	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YPR015C	Q12531	247 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RGT1	YKL038W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YHR131C	P38835	850 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GAA1	P39012	614 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PRM9	P39551	298 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YGR201C	P42936	225 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GMC1	Q04399	608 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	THI7	Q05998	598 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.6	not detected
RGT1	YKL038W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YCR102C	P25608	368 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MRPL9	P31334	269 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	TFA2	P36145	328 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YBR013C	P38215	129 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	AAD14	P42884	376 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CHA4	P43634	648 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MTO1	P53070	669 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PRM1	P53835	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RNH202	Q05635	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	DUS4	Q06063	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RIF2	Q06208	395 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	DIN7	Q12086	430 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GAL80	P04387	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YPK2	P18961	677 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MRP4	P32902	394 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MRPL28	P36527	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YHR033W	P38690	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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