RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	POM33	Q12164	279 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BBP1	Q12365	385 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	AGC1	Q12482	902 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RGS2	Q99188	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SAC7	P17121	654 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SPT10	P35208	640 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ECM10	P39987	644 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YGR168C	P53293	376 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	CSM3	Q04659	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GAS5	Q08193	484 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ATP16	Q12165	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RTR2	Q12378	196 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PCT1	P13259	424 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	KAR9	P32526	644 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YBR144C	P34215	104 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SHG1	P38337	142 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	HIS2	P38635	335 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	HAT2	P39984	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FCY21	P40039	528 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YFL054C	P43549	646 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SSY5	P47002	699 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YJR030C	P47101	745 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PHB2	P50085	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	TIM44	Q01852	431 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ERP3	Q12403	225 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RMD5	Q12508	421 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YOR1	P53049	1477 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ARG82	P07250	355 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YCR015C	P25616	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	IES6	P32617	166 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
SET1	YHR119W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	UBA4	P38820	440 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	IKI1	P38874	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FMP52	P40008	231 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GIP2	P40036	548 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FKH1	P40466	484 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GDS1	P41913	522 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	CIN2	P46670	268 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RPC17	P47076	161 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	AAT1	Q01802	451 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SSY1	Q03770	852 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RIM13	Q03792	727 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PLB3	Q08108	686 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SIA1	Q12212	622 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SNF3	P10870	884 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YJL206C	P39529	758 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	COA1	P40452	197 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SPT20	P50875	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YTP1	P53584	459 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	KIN4	Q01919	800 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	REC102	Q02721	264 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	TRM82	Q03774	444 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	NSL1	Q12143	216 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SCEI	P03882	235 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YBL010C	P32788	280 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GPI16	P38875	610 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FAR3	P46671	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	TAX4	P47030	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YDR209C	Q03480	137 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	OST6	Q03723	332 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SOG2	Q08817	791 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FUB1	P25659	250 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
SET1	YHR119W	RTG1	P32607	177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91

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