RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	VPS33	P20795	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ZIP1	P31111	875 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	DEP1	P31385	405 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SSO1	P32867	290 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PDR3	P33200	976 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	IST2	P38250	946 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	IFA38	P38286	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CHS7	P38843	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	NNF2	P53253	936 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SLI1	P53304	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TRS23	Q03784	219 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	DYN3	Q04949	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPN6	Q12377	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SNF8	Q12483	233 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	UNG1	P12887	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	BUD14	P27637	709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	NUP2	P32499	720 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SCO2	P38072	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ROT2	P38138	954 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TRM5	P38793	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	VPS52	P39904	641 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	GET2	P40056	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	BAP3	P41815	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MSC1	Q03104	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	HSP31	Q04432	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	GGA1	Q06336	557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MUM3	Q08750	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ARG3	P05150	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CDC26	P14724	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	DAP2	P18962	818 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	APN1	P22936	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YCL049C	P25577	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	DAL3	P32459	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SEC17	P32602	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MSN2	P33748	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPS27B	P38711	82 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YHR210C	P38893	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PAC10	P48363	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	KEL2	P50090	882 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	UBC11	P52492	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PEX25	Q02969	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RAD33	Q04231	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	BCP1	Q06338	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PSR1	Q07800	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FDH1	Q08911	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	REX3	Q12090	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	IRA1	P18963	3092 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	COX1	P00401	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ARG81	P05085	880 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPB5	P20434	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	LDB16	P25587	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PMT2	P31382	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ORC2	P32833	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	AIM2	P39721	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YJL068C	P40363	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YIL152W	P40455	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ICE2	P40499	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YJL043W	P47053	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	STE24	P47154	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RHO4	Q00246	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	VPS36	Q06696	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MFG1	Q07684	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	HSP42	Q12329	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TMA17	Q12513	150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SAN1	P22470	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MXR2	P25566	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FAT1	P38225	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RCK1	P38622	512 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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