RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YMR155W	Q03795	547 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YLR345W	Q06137	509 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YOR376W	Q08900	122 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MTR10	Q99189	972 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AFI1	Q99222	893 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	STE7	P06784	515 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GIT1	P25346	518 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ERV1	P27882	189 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	NFU1	P32860	256 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SPO23	P33757	523 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ECM8	P38246	354 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	STN1	P38960	494 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FRT2	P39734	528 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SER3	P40054	469 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	VHS2	P40463	436 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ABM1	P47146	123 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RRN9	P53437	365 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	VAC7	P53950	1165 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SPR6	Q01684	191 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SMC4	Q12267	1418 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	REC107	P21651	314 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TOA1	P32773	286 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TOA2	P32774	122 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SOL2	P37262	315 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SMP1	P38128	452 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	INM1	P38710	295 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	WSC4	P38739	605 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PEX22	P39718	180 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SPO73	P40031	143 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	STE24	P47154	453 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	COQ5	P49017	307 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PMT5	P52867	743 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPN14	P53196	417 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YDR115W	Q04598	105 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MSC3	Q05812	728 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YLR287C	Q05881	355 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YLR177W	Q06251	628 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MED2	Q12124	431 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RUP1	Q12242	671 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SFI1	Q12369	946 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YOP1	Q12402	180 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	OPI3	P05375	206 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CDC21	P06785	304 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ADK2	P26364	225 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ANP1	P32629	500 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TIR2	P33890	251 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SKT5	P34226	696 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HST4	P53688	370 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RNH203	Q12338	110 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	APC2	Q12440	853 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PCL9	Q12477	304 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GEP4	P38812	185 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CIN2	P46670	268 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TCB2	P48231	1178 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	VEL1	P53058	206 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YDR131C	Q03899	556 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YLR456W	Q06199	204 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HRT1	Q08273	121 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SRO7	Q12038	1033 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	VPS54	Q12071	889 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SFM1	Q12314	213 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SCM3	Q12334	223 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TPK3	P05986	398 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL12B	P0CX54	165 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	UNG1	P12887	359 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected

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