RNA–Protein interactions for RNA: YGR082W

TOM20, Transcript of Component of the TOM (translocase of outer membrane) complex, yeast

Gene TOM20, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM20	YGR082W	YNR068C	P53754	272 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	ALF1	P53904	254 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YDL114W	Q07530	308 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	GAT3	Q07928	141 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YDL199C	Q12407	687 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	PRR1	P28708	518 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	FUN26	P31381	517 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YET2	Q04210	160 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	PEX27	Q08580	376 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	SPO23	P33757	523 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	RET3	P53600	189 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	TSA2	Q04120	196 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YOR338W	Q99326	363 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	PCL1	P24867	279 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	PCL9	Q12477	304 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TOM20	YGR082W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	MSK1	P32048	576 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	UTH1	P36135	365 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YBL028C	P38202	106 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	SIF2	P38262	535 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	KEG1	P43614	200 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YNL143C	P53908	130 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	HAL1	Q01766	294 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YER186C	P40101	306 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	CIN2	P46670	268 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	AIM33	Q04516	312 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	LIP2	Q06005	328 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	MRPL8	P22353	238 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	RDS1	P25611	832 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	OM14	P38325	134 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	MCT1	Q12283	360 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	CDC50	P25656	391 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	DFG10	P40526	253 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	STE3	P06783	470 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	MAS2	P11914	482 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	TIM17	P39515	158 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	SNL1	P40548	159 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	MPS2	P53159	387 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YGR016W	P53209	190 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YLH47	Q06493	454 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	SHS1	Q07657	551 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	FSH3	Q99369	266 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
TOM20	YGR082W	SAG1	P20840	650 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	OPI1	P21957	404 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	VAM7	P32912	316 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	HEM14	P40012	539 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	EFM3	P47163	339 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	AQR1	P53943	586 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	GRR1	P24814	1151 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	PFS1	P38872	237 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TOM20	YGR082W	SPT7	P35177	1332 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	CAJ1	P39101	391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	PSY3	Q12318	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	PRB1	P09232	635 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	FAR1	P21268	830 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	SEC9	P40357	651 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	PGU1	P47180	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	MAS1	P10507	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	ZRC1	P20107	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	CKI1	P20485	582 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TOM20	YGR082W	NAS2	P40555	220 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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