RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 GPR149Q86SP6 731 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TRIM50Q86XT4 487 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 RMDN3Q96TC7 470 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TMX1Q9H3N1 280 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 WASF3Q9UPY6 502 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SQORQ9Y6N5 450 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MIA3Q5JRA6 1907 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 C2orf16Q68DN1 1984 aa13.58□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 NR3C2P08235 984 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TRIM27P14373 513 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 EPCAMP16422 314 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SLC44A3Q8N4M1 653 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 LIMK1P53667 647 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 BECN1Q14457 450 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TMC7Q7Z402 723 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 GATA6Q92908 595 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 USP26Q9BXU7 913 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PXMP2Q9NR77 195 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 EPS15L1Q9UBC2 864 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PADI3Q9ULW8 664 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.56□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 RETP07949 1114 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TDGF1P13385 188 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PPM1AP35813 382 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 CSRP2Q16527 193 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 LETM2Q2VYF4 491 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 USH1GQ495M9 461 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 SFXN1Q9H9B4 322 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MTMR7Q9Y216 660 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.55□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MGEA5O60502 916 aa13.54□□□□□ -0.24
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HCG18-241ENST00000602290 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 KCNT2Q6UVM3 1135 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 LRRC55Q6ZSA7 311 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 RSPH3Q86UC2 560 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 BCO2Q9BYV7 579 aa13.54□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 ESPNB1AK53 854 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TGFB3P10600 412 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 PDHBP11177 359 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MAGEA9P43362 315 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TDO2P48775 406 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 GHRHRQ02643 423 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 OSBP2Q969R2 916 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 NXPE3Q969Y0 559 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 BOLA2Q9H3K6 86 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 TELO2Q9Y4R8 837 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 IRAK3Q9Y616 596 aa13.53□□□□□ -0.24
HCG18-241ENST00000602290 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 C9IYK1 514 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SNHG28P0DPA3 235 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PAK2Q13177 524 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PTPN14Q15678 1187 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LPAL2Q16609 132 aa13.52□□□□□ -0.25
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