RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565379.1

NME3-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 911 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-208ENST00000565379 ZNF302Q9NR11 478 aa29.08■■■□□ 2.25
NME3-208ENST00000565379 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.08■■■□□ 2.25
NME3-208ENST00000565379 LRWD1Q9UFC0 647 aa29.08■■■□□ 2.25
NME3-208ENST00000565379 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.08■■■□□ 2.25
NME3-208ENST00000565379 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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NME3-208ENST00000565379 H3BRB1 525 aa29.07■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 EML1O00423 815 aa29.07■■■□□ 2.24
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NME3-208ENST00000565379 PITPNM1O00562 1244 aa29.06■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 MYOGP15173 224 aa29.06■■■□□ 2.24
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NME3-208ENST00000565379 MUTP22033 750 aa29.05■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 PSMC5P62195 406 aa29.05■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 IL17AQ16552 155 aa29.05■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 TRIM50Q86XT4 487 aa29.05■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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NME3-208ENST00000565379 PCYT2Q99447 389 aa29.05■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.05■■■□□ 2.24
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NME3-208ENST00000565379 PDXDC2PQ6P474 469 aa29.04■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 FAM167AQ96KS9 214 aa29.04■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 SPATA32Q96LK8 384 aa29.04■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.04■■■□□ 2.24
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NME3-208ENST00000565379 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa29.03■■■□□ 2.24
NME3-208ENST00000565379 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29.03■■■□□ 2.24
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NME3-208ENST00000565379 CKBP12277 381 aa29.01■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 RPA1P27694 616 aa29.01■■■□□ 2.23
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NME3-208ENST00000565379 SLITRK3O94933 977 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 LYPLA2O95372 231 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 SELPP16109 830 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 ME1P48163 572 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 RAB30Q15771 203 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 LRRC8DQ7L1W4 858 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 C4orf19Q8IY42 314 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 CKAP2LQ8IYA6 745 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 CAGE1Q8TC20 777 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 ATP8B4Q8TF62 1192 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 DYDC2Q96IM9 177 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 LXNQ9BS40 222 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 MSRAQ9UJ68 235 aa29■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 HBP1O60381 514 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 NBNO60934 754 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 PFKMP08237 780 aa28.99■■■□□ 2.23
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NME3-208ENST00000565379 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 RFC2P35250 354 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 TXLNAP40222 546 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 UBA7P41226 1012 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 RBL2Q08999 1139 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 MBTPS1Q14703 1052 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 XKR3Q5GH77 459 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.99■■■□□ 2.23
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NME3-208ENST00000565379 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 CSRNP2Q9H175 543 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.99■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 POTEB3A0JP26 581 aa28.98■■■□□ 2.23
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NME3-208ENST00000565379 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 PTK7Q13308 1070 aa28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 PLCB4Q15147 1175 aa28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 POTEBQ6S5H4 581 aa28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 TPH2Q8IWU9 490 aa28.98■■■□□ 2.23
NME3-208ENST00000565379 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.98■■■□□ 2.23
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