RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 149.1
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLIC4Q9Y696 253 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 UTRNP46939 3433 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLRF2D3W0D1 207 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPTLC2O15270 562 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 IFNAR1P17181 557 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMARCA1P28370 1054 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC1A4P43007 532 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP14P54578 494 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPM4P67936 248 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TROAPQ12815 778 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC96Q2M329 555 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANO1Q5XXA6 986 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLFN13Q68D06 897 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 LDHDQ86WU2 507 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP120Q8N960 986 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCAF4Q8WV16 495 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDCA5Q96FF9 252 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABHD8Q96I13 439 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FEZ1Q99689 392 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SDF4Q9BRK5 362 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC18Q9H819 358 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYH4Q9Y623 1939 aa6.32□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 STK36Q9NRP7 1315 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1B0GVL5 298 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 HMX2A2RU54 273 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF28PB7ZC32 967 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 C19orf81C9J6K1 198 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADM5C9JUS6 153 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 F5H6K3 240 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FSCN2O14926 492 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP6R2O75170 966 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEXIO95424 95 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 BMP3P12645 472 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CMA1P23946 247 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC27P30260 824 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDUFA8P51970 172 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP12P59046 1061 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLRC3Q07444 240 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 HYAL2Q12891 473 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRMPQ12912 555 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAF1Q13077 416 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRM4Q14833 912 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATCAYQ86WG3 371 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHKBQ93100 1093 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIGD1Q96MW7 591 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 HHIPQ96QV1 700 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALG1Q9BT22 464 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNTN3Q9P232 1028 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 STOML1Q9UBI4 398 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMX2Q9Y320 296 aa6.31□□□□□ -1.4
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