RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 H2AFZP0C0S5 128 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR3Q13615 1198 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD1Q719H9 257 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 H2AFVQ71UI9 128 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP3O75969 853 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX26Q7Z412 305 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 SFR1Q86XK3 245 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 KRIT1O00522 736 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS36Q86VN1 386 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 UIMC1Q96RL1 719 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 REEP2Q9BRK0 252 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH4Q9Y623 1939 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 TBX3O15119 743 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 RPA1P27694 616 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 POLLQ9UGP5 575 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMC6P62333 389 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 ERMNQ8TAM6 284 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35C1Q96A29 364 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 HES6Q96HZ4 224 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 DNM3Q9UQ16 869 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-201ENST00000218364 E7EVH7 732 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO1FO00160 1098 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.458e-17■■■■■ 39.9
HTATSF1-201ENST00000218364 GFPT2O94808 682 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 AP3B2Q13367 1082 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 BTAF1O14981 1849 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 ASTN1O14525 1302 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 NR3C1P04150 777 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 STK24Q9Y6E0 443 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGA4P13612 1032 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 FERP16591 822 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.453e-16■■■■■ 35.7
HTATSF1-201ENST00000218364 Q4G0T1 1027 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 AMACRQ9UHK6 382 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 GMNCA6NCL1 334 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 FLT3P36888 993 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 DRP2Q13474 957 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCB4Q15147 1175 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 POTEAQ6S8J7 498 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 MEIS2O14770 477 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 DAPK3O43293 454 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAPPC3O43617 180 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 BBOX1O75936 387 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 CABS1Q96KC9 395 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PAEPP09466 180 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP4P98171 946 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 BORCS6Q96GS4 357 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPHQ9H3R5 247 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 VCPKMTQ9H867 229 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2IP78347 998 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 DAAM2Q86T65 1068 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 GCNT4Q9P109 453 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 CASP4P49662 377 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R2AP63151 447 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPROQ16827 1216 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-201ENST00000218364 LENG9Q96B70 501 aa24.1■■□□□ 1.45
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