RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RPL12BP0CX54 165 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PCL1P24867 279 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C DPH2P32461 534 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YEF1P32622 495 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MRPL10P36520 322 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C KAP104P38217 918 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YHR131CP38835 850 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ATM1P40416 690 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C GAB1P41733 394 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C EPL1P43572 832 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C LCB3P47013 409 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ASN2P49090 572 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C COS1P53822 381 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CUE5Q08412 411 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data1.54□□□□□ -2.16not detected
HDA3YPR179C TPK3P05986 398 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ARF1P11076 181 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SKT5P34226 696 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C DOA1P36037 715 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SPP381P38282 291 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C WSS1P38838 269 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RTT102P53330 157 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ADA2Q02336 434 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C IPK1Q06667 281 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ASA1Q06822 443 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YDR061WQ12298 539 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YOP1Q12402 180 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C EAF3Q12432 401 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C IZH2Q12442 317 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PIS1P06197 220 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MSI1P13712 422 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NUP2P32499 720 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C BLI1P35727 113 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MCR1P36060 302 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YHR177WP38867 453 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C HAC1P41546 238 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C AIM24P47127 394 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RRN9P53437 365 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ALF1P53904 254 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YMR102CQ03177 834 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C TDA1Q03533 586 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RIF2Q06208 395 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SMC5Q08204 1093 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C FRE6Q12473 712 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SRN2Q99176 213 aa1.54□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SWI3P32591 825 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MID2P36027 376 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C GPX2P38143 162 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YSW1P38280 609 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YHK8P38776 514 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C GEP4P38812 185 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C AIM10P39965 576 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MAM33P40513 266 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YFR057WP43625 151 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MST27P53176 234 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YPL107WQ02873 248 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YFH1Q07540 174 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C LOT6Q07923 191 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C LDS2Q08218 356 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C AAD15Q08361 143 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PLP2Q12017 286 aa1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RNA1P11745 407 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C DAP2P18962 818 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MSP1P28737 362 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C TOA2P32774 122 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C APE4P38821 490 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C EGT2P42835 1041 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C BIR1P47134 954 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C ABM1P47146 123 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C EOS1P53938 366 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PRM6Q04705 352 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C JID1Q12350 301 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SKS1Q12505 502 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YBL111CQ3E7Y5 667 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPB5P20434 215 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C TIR2P33890 251 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C DAD2P36162 133 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C ECM8P38246 354 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RTC2P38279 296 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MIG3P39943 394 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C BNS1P50084 137 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CRH1P53301 507 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YPR091CQ06833 770 aa1.52□□□□□ -2.17
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