RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C COS7Q07788 383 aa6.33□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MMP1Q12372 583 aa6.33□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MCM1P11746 286 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C KSS1P14681 368 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C GAS1P22146 559 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C CTR86P25355 563 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C TUL1P36096 758 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MGE1P38523 228 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YHR177WP38867 453 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C VPS41P38959 992 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C PRY1P47032 299 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C REX2P54964 269 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YDR476CQ03362 224 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YDR249CQ03787 373 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C HDA2Q06629 674 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YLR036CQ07986 203 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YOL131WQ08270 108 aa6.32□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YMR085WP0CF18 432 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C CBS1P14066 229 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NCP1P16603 691 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YAP1P19880 650 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NFS1P25374 497 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NGG1P32494 702 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NUP2P32499 720 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YEF1P32622 495 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ATG14P38270 344 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RNT1Q02555 471 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SDC1Q03323 175 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C PLB2Q03674 706 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C BUR2Q05949 395 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SGT1Q08446 395 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SNF8Q12483 233 aa6.31□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C PHO81P17442 1178 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C REC107P21651 314 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RPI1P23250 407 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YPT7P32939 208 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MTR2P34232 184 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C TDP1P38319 544 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YGP1P38616 354 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C PRE3P38624 215 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NSG1P38837 291 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C JEM1P40358 645 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C REE1P40893 198 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SMK1P41808 388 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ECL1P48235 211 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YGR066CP53242 292 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MKC7P53379 596 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C INN1P53901 409 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C FAR10Q06001 478 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C HNT3Q08702 217 aa6.3□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C THR1P17423 357 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C AIM17P23180 465 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NPP1P25353 742 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RAD51P25454 400 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RPT5P33297 434 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C APD1P38281 316 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C PTH1P38876 190 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SEN34P39707 275 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YER010CP40011 234 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ALG5P40350 334 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C LSG1P53145 640 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C INP1Q03694 420 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RAD30Q04049 632 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SFH1Q06168 426 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ARR1Q06596 294 aa6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ARG81P05085 880 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C HTS1P07263 546 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C PUT2P07275 575 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C STE6P12866 1290 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C SPS100P13130 326 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RPC19P28000 142 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C TOD6P34219 525 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RSM22P36056 628 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MRPL17P36528 281 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C MAL32P38158 584 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C EXO84P38261 753 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C ZRG8P40021 1076 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C QDR2P40474 542 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C YMR010WQ03687 405 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C RIM13Q03792 727 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C URC2Q04411 772 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C API2Q04413 109 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NAT4Q04751 285 aa6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPE3YPR069C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data6.28□□□□□ -1.4not detected
SPE3YPR069C MEF1P25039 761 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YIM1P28625 365 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C EHD3P28817 500 aa6.27□□□□□ -1.41
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