RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	SKN1	P33336	771 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	LTV1	P34078	463 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	YKL097C	P34245	136 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	RTC2	P38279	296 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	STP2	P38704	541 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	MAM33	P40513	266 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	DFG10	P40526	253 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	HAC1	P41546	238 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	AIM24	P47127	394 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	BIR1	P47134	954 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	MST27	P53176	234 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	ALF1	P53904	254 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	YMR102C	Q03177	834 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	SMC5	Q08204	1093 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	EAF3	Q12432	401 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	ALG1	P16661	449 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	DPH2	P32461	534 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	YHK8	P38776	514 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	GYL1	Q04322	720 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	LOT6	Q07923	191 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	GPM3	Q12326	303 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YCT1	YLL055W	POM152	P39685	1337 aa		2.59	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YEF1	P32622	495 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	COX13	P32799	129 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SPT10	P35208	640 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	UIP5	P36137	443 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	DAD2	P36162	133 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RRF1	P38771	230 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	GPI16	P38875	610 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PES4	P39684	611 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	OXA1	P39952	402 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	LCB2	P40970	561 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	TDA1	Q03533	586 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	NSE1	Q07913	336 aa		2.58	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PDE2	P06776	526 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	MRP21	P38175	177 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	MEP1	P40260	492 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	EGT2	P42835	1041 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	BNS1	P50084	137 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YGR117C	P53270	476 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	CRH1	P53301	507 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	COS1	P53822	381 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SPR6	Q01684	191 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PRM6	Q04705	352 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	LIP2	Q06005	328 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PHO91	P27514	894 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
YCT1	YLL055W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	ATG18	P43601	500 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	CLD1	P53264	445 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	MGR3	Q04472	501 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	NFI1	Q12216	726 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	FRE6	Q12473	712 aa		2.57	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected
YCT1	YLL055W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SMI1	P32566	505 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	SKT5	P34226	696 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	QDR3	P38227	689 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	STE24	P47154	453 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	ROG1	P53118	685 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YET2	Q04210	160 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RNH203	Q12338	110 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.56	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	ATM1	P40416	690 aa		2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	REX3	Q12090	404 aa		2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.55	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	OPI3	P05375	206 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	OM14	P38325	134 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	WSS1	P38838	269 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PCL7	P40186	285 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	PAC11	P40960	533 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	VTI1	Q04338	217 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	ECM7	Q06200	448 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	NDL1	Q06568	189 aa		2.54	□□□□□ -2
YCT1	YLL055W	YPR091C	Q06833	770 aa		2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms