RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
YKL050C	YKL050C	SPT10	P35208	640 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	COS9	P36034	407 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RIB1	P38066	345 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	FES1	P38260	290 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	VHC1	P38329	1120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SDH8	P38345	138 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SBE22	P38814	852 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GPI16	P38875	610 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YFL066C	P43538	392 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YGL159W	P53110	370 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YGL108C	P53139	140 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ARO10	Q06408	635 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	REX4	Q08237	289 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YDL176W	Q12027	708 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
YKL050C	YKL050C	SWM1	Q12379	170 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YPR1	Q12458	312 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MSS51	P32335	436 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MRPL7	P36519	292 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	FET3	P38993	636 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ELO1	P39540	310 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GET2	P40056	285 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	AGE2	P40529	298 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SNL1	P40548	159 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	TAF6	P53040	516 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ORC3	P54790	616 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PLB2	Q03674	706 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	KRE28	Q04431	385 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	DUS4	Q06063	367 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SPO77	Q06134	477 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CDD1	Q06549	142 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RIP1	P08067	215 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	WHI2	P12611	486 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	QDR3	P38227	689 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CIN4	P39110	191 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ICP55	P40051	511 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ATG27	P46989	271 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	TAX4	P47030	604 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	NPA3	P47122	385 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YDL186W	P48568	277 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RRN9	P53437	365 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PEX12	Q04370	399 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CDA2	Q06703	312 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	COX3	P00420	269 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	DAL82	P21705	255 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YSP3	P25036	478 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GAC1	P28006	793 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YSC83	P32792	385 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	BIG1	P38813	335 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	COQ9	Q05779	260 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CDC123	Q05791	360 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	AFT2	Q08957	416 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	TRM11	Q12463	433 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SCEI	P03882	235 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	AAC1	P04710	309 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ELO2	P25358	347 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	TRM2	P33753	639 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	NUF2	P33895	451 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	LHS1	P36016	881 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MSY1	P48527	492 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	FHN1	P53279	174 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	AAD15	Q08361	143 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GPM2	Q12008	311 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RGS2	Q99188	309 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85

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