RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.79	□□□□□ -1.96	RIP-Chip
VMA10	YHR039C-A	SPR6	Q01684	191 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	ESA1	Q08649	445 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	YOP1	Q12402	180 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	CYC3	P06182	269 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	MSK1	P32048	576 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	SRB2	P34162	210 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	YBR139W	P38109	508 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	GPX2	P38143	162 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	SBE22	P38814	852 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	YHR218W	P38899	603 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	SPG5	P42933	373 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	NCA3	P46955	337 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	ABM1	P47146	123 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	MTM1	P53320	366 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	ADA2	Q02336	434 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	SMA2	Q04658	369 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	SPH1	Q06160	661 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	ERV2	Q12284	196 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA10	YHR039C-A	TRP1	P00912	224 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	MAS2	P11914	482 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	GRR1	P24814	1151 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	CPR3	P25719	182 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	KAR9	P32526	644 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	SUR1	P33300	382 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YHR122W	P38829	231 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	PES4	P39684	611 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	HST1	P53685	503 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	BOR1	P53838	576 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	HER2	Q03557	464 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RRN11	Q04712	507 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	MDM36	Q06820	579 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	MAS1	P10507	462 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	SDH3	P33421	198 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RRF1	P38771	230 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	NDE2	Q07500	545 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YRM1	Q12340	786 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	FSH3	Q99369	266 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	HMX1	P32339	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	VAM7	P32912	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	TIR2	P33890	251 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	GEP4	P38812	185 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YDR089W	P38966	869 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	COX14	P39103	70 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	OSW5	P40219	148 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	SNL1	P40548	159 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	MRM2	P53123	320 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	NUP116	Q02630	1113 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	VPS20	Q04272	221 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	AIM33	Q04516	312 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	PBA1	Q05778	276 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YOR338W	Q99326	363 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	CLN3	P13365	580 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	CKI1	P20485	582 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	MRPL8	P22353	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	HXT2	P23585	541 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YBL059W	P34224	193 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	PCH2	P38126	564 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YHK8	P38776	514 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YIL029C	P40538	142 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	REE1	P40893	198 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	GAT3	Q07928	141 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	TLG2	Q08144	397 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	AHC1	Q12433	566 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	MNS1	P32906	549 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	ALP1	P38971	573 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YHC3	P47040	408 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YMR102C	Q03177	834 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	ABZ2	Q03266	374 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	TDA1	Q03533	586 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	STE23	Q06010	1027 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	LOT6	Q07923	191 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YOR387C	Q08910	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA10	YHR039C-A	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97

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