RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W YLR346CQ06139 101 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W DIN7Q12086 430 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MSF1P08425 469 aa12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W UTR1P21373 530 aa12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W CWH43P25618 953 aa12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W LSM8P47093 109 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W CWC24P53769 259 aa12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W TY1A-DR3Q12441 440 aa12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SSA4YER103W GAL80P04387 435 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RBK1P25332 333 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W ADD66P36040 267 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W FMC1P40491 155 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W GTS1P40956 396 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W BAP3P41815 604 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YMR279CQ03263 540 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YLR108CQ12259 485 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RNA14P25298 677 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W VPS17P32913 551 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SRY1P36007 326 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YKL077WP36081 392 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YJR124CP47159 448 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W ESC8Q08119 714 aa12.09□□□□□ -0.47
SSA4YER103W GAL1P04385 528 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PET9P18239 318 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MAG1P22134 296 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PRP28P23394 588 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MRPL9P31334 269 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TMA19P35691 167 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W LAG1P38703 411 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MEP1P40260 492 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PFS2P42841 465 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MRX6P48564 524 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W NMD4Q12129 218 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W SVS1Q12254 260 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YOL114CQ12322 202 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YOS9Q99220 542 aa12.08□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CDC21P06785 304 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W SRB6P32570 121 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W WBP1P33767 430 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W LOT5P34234 306 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data12.07□□□□□ -0.48not detected
SSA4YER103W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GAD1Q04792 585 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VID22Q05934 901 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ISC10P32645 267 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VPS51P36116 164 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W SWM2P40342 146 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GTT1P40582 234 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ROG1P53118 685 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W HHO1P53551 258 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YNL034WP53963 612 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W EAR1Q03212 550 aa12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MER1P16523 270 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PPH22P23595 377 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W LHP1P33399 275 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MKS1P34072 584 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W COS8P38723 381 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RTT105P40063 208 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GAT1P43574 510 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YJL043WP47053 257 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W AAT1Q01802 451 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W KAP120Q02932 1032 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YML020WQ03722 664 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CRR1Q05790 422 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W DGK1Q12382 290 aa12.06□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W UBA4P38820 440 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RFC4P40339 323 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PKP1P40530 394 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W HIS6P40545 261 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PSA1P41940 361 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YGR201CP42936 225 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W QRI7P43122 407 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ERV25P54837 211 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W SFM1Q12314 213 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PSF1Q12488 208 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ERD2P18414 219 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YBL010CP32788 280 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MRPL36P36531 177 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VAC8P39968 578 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GIP3Q03016 1276 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TRM8Q12009 286 aa12.05□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MED4Q12343 284 aa12.05□□□□□ -0.48
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