RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2 RIP-Chip
NTF2YER009W TPK3P05986 398 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W RPB5P20434 215 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W HXT1P32465 570 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W SKT5P34226 696 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W DOA1P36037 715 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W MCR1P36060 302 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W MNL1P38888 796 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W MAM33P40513 266 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W HAC1P41546 238 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W YFR057WP43625 151 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W YIP5P53108 310 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W MST27P53176 234 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W RTT102P53330 157 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W ALF1P53904 254 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W TDA1Q03533 586 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W LOT6Q07923 191 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W YOP1Q12402 180 aa2.58□□□□□ -2
NTF2YER009W NUP2P32499 720 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W GPX2P38143 162 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W KAP104P38217 918 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W GAB1P41733 394 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W MLC1P53141 149 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W RRN9P53437 365 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W ERO1Q03103 563 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W PRM6Q04705 352 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W IPK1Q06667 281 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W ASA1Q06822 443 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.57□□□□□ -2
NTF2YER009W NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W PUP2P32379 260 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W TOA2P32774 122 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W RTC2P38279 296 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W MIG3P39943 394 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W EGT2P42835 1041 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W BIR1P47134 954 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W BNS1P50084 137 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W CRH1P53301 507 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W RCF1Q03713 159 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W AAD15Q08361 143 aa2.56□□□□□ -2
NTF2YER009W HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W PRR1P28708 518 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W TIR2P33890 251 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W RXT2P38255 430 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W GEP4P38812 185 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W EPL1P43572 832 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W CLD1P53264 445 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W LDS2Q08218 356 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W SRN2Q99176 213 aa2.55□□□□□ -2
NTF2YER009W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W PCL1P24867 279 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W SPT10P35208 640 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W WSS1P38838 269 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W YHR177WP38867 453 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W OXA1P39952 402 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W DFG10P40526 253 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W ATG18P43601 500 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W HAL1Q01766 294 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W YPR091CQ06833 770 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W MFG1Q07684 458 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W FCY22Q12119 530 aa2.54□□□□□ -2
NTF2YER009W UTH1P36135 365 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W ECM8P38246 354 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W ABM1P47146 123 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W TSA2Q04120 196 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W YET2Q04210 160 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W LIP2Q06005 328 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W YDL114WQ07530 308 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W YFH1Q07540 174 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W YDR061WQ12298 539 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W NAG1Q8TGN9 163 aa2.53□□□□□ -2
NTF2YER009W DPH2P32461 534 aa2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YSW1P38280 609 aa2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W EOS1P53938 366 aa2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W FRE6Q12473 712 aa2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W PCL9Q12477 304 aa2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SKS1Q12505 502 aa2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
NTF2YER009W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.51□□□□□ -2.01not detected
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