RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 TRIOO75962 3097 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 USP34Q70CQ2 3546 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 LGALS2P05162 132 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 ICAM3P32942 547 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 NAPAP54920 295 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 UBE2SQ16763 222 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 RSPH3Q86UC2 560 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 KAT6AQ92794 2004 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 LINC01565O15544 149 aa21.94■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.94■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 GNPTABQ3T906 1256 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 NID2Q14112 1375 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.93■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.93■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 TTC3P53804 2025 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 STAM2O75886 525 aa21.92■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 ASIC4Q96FT7 647 aa21.92■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 BARHL2Q9NY43 387 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 CLEC1BQ9P126 229 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 C5orf42Q9H799 3197 aa21.91■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 METTL7BQ6UX53 244 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB33Q86T24 672 aa21.91■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-208ENST00000608287 CFAP54Q96N23 3096 aa21.91■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 SCG2P13521 617 aa21.9■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.9■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 FAM186AA6NE01 2351 aa21.89■■□□□ 1.1
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SGMS1-208ENST00000608287 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-208ENST00000608287 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-208ENST00000608287 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-208ENST00000608287 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-208ENST00000608287 PLXNA3P51805 1871 aa21.88■■□□□ 1.09
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