RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PTK7Q13308 1070 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 BFSP2Q13515 415 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 STK38Q15208 465 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 UGCGQ16739 394 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT79Q5XKE5 535 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TPH2Q8IWU9 490 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CFAP45Q9UL16 551 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CLIC4Q9Y696 253 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RAG1P15918 1043 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 HOXC8P31273 242 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 AK8Q96MA6 479 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 USP28Q96RU2 1077 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA0355O15063 1070 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF862O60290 1169 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RSPH3Q86UC2 560 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 C4orf19Q8IY42 314 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RETREG2Q8NC44 543 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CAGE1Q8TC20 777 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 HIPK3Q9H422 1215 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RGL1Q9NZL6 768 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TBX21Q9UL17 535 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR81Q562E7 1941 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 KAT6AQ92794 2004 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP2C9P11712 490 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP4AP20648 1035 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 MUTP22033 750 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SERINC5Q86VE9 423 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PPME1Q9Y570 386 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TREHO43280 583 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SLITRK3O94933 977 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 YEATS4O95619 227 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RPA1P27694 616 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC39A14Q15043 492 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PITPNM1O00562 1244 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 MAGEB2O15479 319 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CAND2O75155 1236 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 LYPLA2O95372 231 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SYN1P17600 705 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPAQ15257 358 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 MTERF2Q49AM1 385 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC26A4O43511 780 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TIMP1P01033 207 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TXLNAP40222 546 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 UBA7P41226 1012 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT85P78386 507 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM17P78536 824 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 NACC1Q96RE7 527 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SPTLC2O15270 562 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 KLRC1P26715 233 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TMOD1P28289 359 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 HIC1Q14526 733 aa24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms