RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBTPS1Q14703 1052 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRIK4Q16099 956 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF484Q5JVG2 852 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POTEBQ6S5H4 581 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RETREG2Q8NC44 543 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOD1Q9Y239 953 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL1A2P08123 1366 aa12.67□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIF28PB7ZC32 967 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GJB2P29033 226 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCL23P55773 120 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPFIA1Q13136 1202 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLFN12Q8IYM2 578 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C4orf32Q8N8J7 132 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GJA10Q969M2 543 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP89Q96ST8 783 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SQORQ9Y6N5 450 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR81Q562E7 1941 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EML1O00423 815 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NBNO60934 754 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGBP02675 491 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GUCY1B3Q02153 619 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPHA7Q15375 998 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF365Q70YC5 407 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NME8Q8N427 588 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCLYQ96I15 445 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM167AQ96KS9 214 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KAT6AQ92794 2004 aa12.65□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TET1Q8NFU7 2136 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BACH1O14867 736 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYPLA2O95372 231 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RSPH10BP0C881 870 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHMP4BP1P59074 171 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MGAT3Q09327 533 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTHFD1LQ6UB35 978 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC01465Q8N7H1 131 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UIMC1Q96RL1 719 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NRBP2Q9NSY0 501 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDHA12Q9UN75 941 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.64□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TANC1Q9C0D5 1861 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRANK1O15050 2925 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAGEB2O15479 319 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAIAP3O94812 1187 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C22orf31O95567 290 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHRNA1P02708 482 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MARK3P27448 753 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMC5P62195 406 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALCRLQ16602 461 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UGCGQ16739 394 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XKR3Q5GH77 459 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C4orf19Q8IY42 314 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRPC6Q9Y210 931 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPME1Q9Y570 386 aa12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEMFO60524 1076 aa12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLITRK3O94933 977 aa12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OATP04181 439 aa12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACRP10323 421 aa12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDCP20941 246 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms