RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YPS7Q06325 596 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YEH1Q07804 573 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL131WQ08270 108 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR365CQ08844 703 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M NCA2Q12374 616 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL068W-AQ3E826 78 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M Q0144Q9ZZW2 109 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M MEC1P38111 2368 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SSA3P09435 649 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M STE6P12866 1290 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M STE12P13574 688 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ERD1P16151 362 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M AAC3P18238 307 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CCA1P21269 546 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YCK1P23291 538 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD51P25454 400 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CTS1P29029 562 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M KRE6P32486 720 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MKK1P32490 508 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NGG1P32494 702 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP2P32499 720 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M EMP70P32802 667 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TPO5P36029 618 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MIA40P36046 403 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ALG3P38179 458 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ANS1P38832 159 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR177WP38867 453 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DSS1P39112 969 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PAC1P39946 494 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RGI1P40043 161 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SHO1P40073 367 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M REE1P40893 198 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NIT2P47016 307 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BIT61P47041 543 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PGU1P47180 361 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PAC10P48363 199 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TAF6P53040 516 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR066CP53242 292 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MKC7P53379 596 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DCP2P53550 970 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PLB2Q03674 706 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SNX41Q04053 625 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM11Q04110 302 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CRR1Q05790 422 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HDA2Q06629 674 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DCI1Q08558 271 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M UAF30Q08747 228 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HER1Q12276 1246 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M JLP1Q12358 412 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL033W-AQ86ZR7 236 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TAD3Q9URQ3 322 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR096CO13587 100 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARG3P05150 338 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HTS1P07263 546 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR214C-DP0CX93 97 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BAR1P12630 587 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CWH43P25618 953 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YCR051WP25631 222 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M OXP1P28273 1286 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ATS1P31386 333 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SSH4P32343 579 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FRE2P36033 711 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TUL1P36096 758 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL17P36528 281 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SCO2P38072 301 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR062CP38239 180 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M EXO84P38261 753 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M STP2P38704 541 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM34P38728 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS41P38959 992 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL193WP39542 402 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M AYR1P40471 297 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M XBP1P40489 647 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PKP1P40530 394 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.39□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M GAB1P41733 394 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA10P42938 290 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YFR054CP43622 192 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PRY1P47032 299 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ECL1P48235 211 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NAS6P50086 228 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SHE4P51534 789 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR040WP53736 256 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR068CP53754 272 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CUZ1P53899 274 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL058CP53947 316 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M LGE1Q02796 332 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YML119WQ03208 357 aa2.39□□□□□ -2.03
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