RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K YPS7Q06325 596 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YEH1Q07804 573 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL131WQ08270 108 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR365CQ08844 703 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K NCA2Q12374 616 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL068W-AQ3E826 78 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K Q0144Q9ZZW2 109 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MEC1P38111 2368 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SSA3P09435 649 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K STE6P12866 1290 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K STE12P13574 688 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ERD1P16151 362 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K AAC3P18238 307 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CCA1P21269 546 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YCK1P23291 538 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD51P25454 400 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CTS1P29029 562 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K KRE6P32486 720 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MKK1P32490 508 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NGG1P32494 702 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP2P32499 720 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K EMP70P32802 667 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TPO5P36029 618 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MIA40P36046 403 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG3P38179 458 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ANS1P38832 159 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR177WP38867 453 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DSS1P39112 969 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PAC1P39946 494 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RGI1P40043 161 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SHO1P40073 367 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K REE1P40893 198 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NIT2P47016 307 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BIT61P47041 543 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PGU1P47180 361 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PAC10P48363 199 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TAF6P53040 516 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR066CP53242 292 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MKC7P53379 596 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DCP2P53550 970 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PLB2Q03674 706 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SNX41Q04053 625 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM11Q04110 302 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CRR1Q05790 422 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K HDA2Q06629 674 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DCI1Q08558 271 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K UAF30Q08747 228 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K HER1Q12276 1246 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K JLP1Q12358 412 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL033W-AQ86ZR7 236 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TAD3Q9URQ3 322 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR096CO13587 100 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARG3P05150 338 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K HTS1P07263 546 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR214C-DP0CX93 97 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BAR1P12630 587 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CWH43P25618 953 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YCR051WP25631 222 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K OXP1P28273 1286 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ATS1P31386 333 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SSH4P32343 579 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FRE2P36033 711 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TUL1P36096 758 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL17P36528 281 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SCO2P38072 301 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR062CP38239 180 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K EXO84P38261 753 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K STP2P38704 541 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM34P38728 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS41P38959 992 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL193WP39542 402 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K AYR1P40471 297 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K XBP1P40489 647 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PKP1P40530 394 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.39□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K GAB1P41733 394 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA10P42938 290 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YFR054CP43622 192 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PRY1P47032 299 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ECL1P48235 211 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NAS6P50086 228 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SHE4P51534 789 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR040WP53736 256 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR068CP53754 272 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CUZ1P53899 274 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL058CP53947 316 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K LGE1Q02796 332 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YML119WQ03208 357 aa2.39□□□□□ -2.03
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