RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YPS7Q06325 596 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YEH1Q07804 573 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL131WQ08270 108 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR365CQ08844 703 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NCA2Q12374 616 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL068W-AQ3E826 78 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J Q0144Q9ZZW2 109 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MEC1P38111 2368 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SSA3P09435 649 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J STE6P12866 1290 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J STE12P13574 688 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ERD1P16151 362 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J AAC3P18238 307 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CCA1P21269 546 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YCK1P23291 538 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD51P25454 400 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CTS1P29029 562 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J KRE6P32486 720 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MKK1P32490 508 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NGG1P32494 702 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP2P32499 720 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J EMP70P32802 667 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TPO5P36029 618 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MIA40P36046 403 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG3P38179 458 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ANS1P38832 159 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR177WP38867 453 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DSS1P39112 969 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PAC1P39946 494 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RGI1P40043 161 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SHO1P40073 367 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J REE1P40893 198 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NIT2P47016 307 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BIT61P47041 543 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PGU1P47180 361 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PAC10P48363 199 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF6P53040 516 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR066CP53242 292 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MKC7P53379 596 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DCP2P53550 970 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PLB2Q03674 706 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SNX41Q04053 625 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM11Q04110 302 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CRR1Q05790 422 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HDA2Q06629 674 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DCI1Q08558 271 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J UAF30Q08747 228 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HER1Q12276 1246 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J JLP1Q12358 412 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL033W-AQ86ZR7 236 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TAD3Q9URQ3 322 aa2.4□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR096CO13587 100 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARG3P05150 338 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HTS1P07263 546 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR214C-DP0CX93 97 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BAR1P12630 587 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CWH43P25618 953 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR051WP25631 222 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J OXP1P28273 1286 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ATS1P31386 333 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SSH4P32343 579 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE2P36033 711 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TUL1P36096 758 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL17P36528 281 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SCO2P38072 301 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR062CP38239 180 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J EXO84P38261 753 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J STP2P38704 541 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM34P38728 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS41P38959 992 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL193WP39542 402 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J AYR1P40471 297 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J XBP1P40489 647 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PKP1P40530 394 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.39□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J GAB1P41733 394 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA10P42938 290 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR054CP43622 192 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PRY1P47032 299 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ECL1P48235 211 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NAS6P50086 228 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SHE4P51534 789 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR040WP53736 256 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR068CP53754 272 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CUZ1P53899 274 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL058CP53947 316 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J LGE1Q02796 332 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YML119WQ03208 357 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms