RNA–Protein interactions for RNA: YNR034W

SOL1, Transcript of Protein with a possible role in tRNA export, yeast

Gene SOL1, Length 966 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOL1	YNR034W	REC102	Q02721	264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	GRX5	Q02784	150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	ARL3	Q02804	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	YML131W	Q03102	365 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	NHP10	Q03435	203 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	MAK3	Q03503	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	GPI11	Q06636	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	TPO1	Q07824	586 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	PEX27	Q08580	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	DDC1	Q08949	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	AEP3	Q12089	606 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	DAP1	Q12091	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	NBP2	Q12163	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	ECM3	Q99252	613 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	TAO3	P40468	2376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SOL1	YNR034W	GCN4	P03069	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	CHS1	P08004	1131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	ABF1	P14164	731 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	AAC3	P18238	307 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	PHO80	P20052	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	BET2	P20133	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	RHB1	P25378	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	DBF20	P32328	564 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	VPS17	P32913	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	DUT1	P33317	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	AGP2	P38090	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YBL029W	P38201	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	SIF2	P38262	535 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	LNP1	P38878	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
SOL1	YNR034W	VAC8	P39968	578 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	MGS1	P40151	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	NBP35	P52920	328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YNR068C	P53754	272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	OCA2	P53949	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	HXT11	P54862	567 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	REG1	Q00816	1014 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	UGO1	Q03327	502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	AIM36	Q03798	255 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	RKM2	Q03942	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	MHR1	Q06630	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	SWA2	Q06677	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	TRE2	Q08693	809 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	SVS1	Q12254	260 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	DCN1	Q12395	269 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	SUC2	P00724	532 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	REP2	P03872	296 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	PET54	P10834	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	APE1	P14904	514 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	SGF29	P25554	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	MKK2	P32491	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	FRE2	P36033	711 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	CCZ1	P38273	704 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	HSE1	P38753	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	FMP52	P40008	231 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	MND2	P40577	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	MAD2	P40958	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	RTS2	P40962	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	ERR3	P42222	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	RPE1	P46969	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YJL132W	P47014	750 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	PMT5	P52867	743 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	OKP1	P53298	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	PRM15	Q03262	622 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	GAS3	Q03655	524 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	CDC123	Q05791	360 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	VPS74	Q06385	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	GIC2	Q06648	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	CDA2	Q06703	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SOL1	YNR034W	YOS9	Q99220	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.5 ms