RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W RAV1P47104 1357 aa3.86□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HTB1P02293 131 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HTB2P02294 131 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W GAL10P04397 699 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SNF5P18480 905 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CKI1P20485 582 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YUR1P26725 428 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RML2P32611 393 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YBL010CP32788 280 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W EMP70P32802 667 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W GSP1P32835 219 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W DRE2P36152 348 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SRL3P36167 246 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data3.85□□□□□ -1.79 RIP-Chip
YPT53YNL093W IML3P38265 245 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W MIC12P38341 106 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W STB5P38699 743 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W TRM5P38793 499 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W ALP1P38971 573 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W NUP60P39705 539 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YAT2P40017 923 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SDP1P40479 209 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W BUD8P41698 603 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W BAP3P41815 604 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W IME4P41833 600 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YGR201CP42936 225 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W ZAP1P47043 880 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HXT16P47185 567 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RFX1P48743 811 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CTR1P49573 406 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W PHO23P50947 330 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W REC102Q02721 264 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W FIN1Q03898 291 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W VPS64Q03944 604 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SHS1Q07657 551 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W NSE1Q07913 336 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W TMA16Q08687 178 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W UPC2Q12151 913 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YPL150WQ12152 901 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SFM1Q12314 213 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SPE4Q12455 300 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W VCX1Q99385 411 aa3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W COQ4O13525 335 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CDC8P00572 216 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W REP1P03871 373 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CDC6P09119 513 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W COS2P0CX12 379 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W COS3P0CX13 379 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HMG2P12684 1045 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W URA4P20051 364 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W VPS33P20795 691 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CNA1P23287 553 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HCM1P25364 564 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPS5P26783 225 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W ERG9P29704 444 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W DUG2P38149 878 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W DER1P38307 211 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W TDP1P38319 544 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W TSC10P38342 320 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CCT6P39079 546 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SNL1P40548 159 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W IRC8P47046 822 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W AIM22P47051 409 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W NBP35P52920 328 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W INN1P53901 409 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W MTQ1P53944 314 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W SPP2Q02521 185 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YPL080CQ02826 108 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W EKI1Q03764 534 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RKM2Q03942 479 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W PLP1Q04004 230 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YLR407WQ06070 228 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W YLR036CQ07986 203 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W FRE3Q08905 711 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W EMP46Q12396 444 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W Q0142Q9ZZW4 58 aa3.84□□□□□ -1.79
YPT53YNL093W QCR7P00128 127 aa3.83□□□□□ -1.8
YPT53YNL093W SCEIP03882 235 aa3.83□□□□□ -1.8
YPT53YNL093W SPE1P08432 466 aa3.83□□□□□ -1.8
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