RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YIL169C	P40442	995 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	TRS85	P46944	698 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	IRC15	Q02733	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	GTO3	Q04806	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	GEP3	Q08622	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	JIP3	O13555	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PDE2	P06776	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	UNG1	P12887	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PMR1	P13586	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CDC23	P16522	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YCR043C	P25361	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PET18	P25362	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	NDI1	P32340	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ECM25	P32525	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	FRE2	P36033	711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YCR041W	P37265	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ELP2	P42935	788 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	VPS20	Q04272	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CSI1	Q04368	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	LDB17	Q12342	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	COX3	P00420	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	TPO5	P36029	618 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RSM22	P36056	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MRPL4	P36517	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PCA1	P38360	1216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MET30	P39014	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PHO86	P46956	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	IKS1	P47042	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	FMP42	Q04991	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	VPS74	Q06385	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YFH1	Q07540	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RSR1	P13856	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	DAP2	P18962	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	ACP1	P32463	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	PFF1	P38244	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	MNL1	P38888	796 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	MSS2	P40990	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	GWT1	P47026	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YIP1	P53039	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RTC4	P53850	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	URC2	Q04411	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RGT2	Q12300	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	PTR2	P32901	601 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YGL242C	P53066	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	MNT4	P53745	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YNL143C	P53908	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	KTR6	P54070	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	PET117	Q02771	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YPT53	P36019	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	MLH1	P38920	769 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	SUR2	P38992	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	FMC1	P40491	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YHC3	P47040	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	HMS2	P47175	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	GTO1	P48239	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	ROG1	P53118	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YOS9	Q99220	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YCR100C	P25606	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YCR022C	P25620	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	CYM1	P32898	989 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	RIM2	P38127	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	TAE1	P38340	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	GPI16	P38875	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YND1	P40009	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YER085C	P40058	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	EFM3	P47163	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	YGL114W	P53134	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	PIB2	P53191	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVJ1	YHR195W	BNA7	Q04066	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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