RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C TPP1Q03796 238 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SND1Q04007 877 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PPN1Q04119 674 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YMR130WQ04223 302 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TRM12Q04235 462 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RTT103Q05543 409 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CDC123Q05791 360 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C VID22Q05934 901 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HDA2Q06629 674 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SNA4Q07549 140 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ENT4Q07872 247 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PEX27Q08580 376 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YPL272CQ08984 517 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C REC8Q12188 680 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FYV7Q12247 151 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SFM1Q12314 213 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GIS3Q12418 502 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C AHC1Q12433 566 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C VMA9Q3E7B6 73 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SUS1Q6WNK7 96 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RGS2Q99188 309 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MTR10Q99189 972 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ERR1P0CX10 437 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ERR2P0CX11 437 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
SPT4YGR063C SNF6P18888 332 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C IDP1P21954 428 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C EPT1P22140 391 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PRE9P23638 258 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GRR1P24814 1151 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DAL2P25335 343 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PUP3P25451 205 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C VAC17P25591 423 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DEG1P31115 442 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ACB1P31787 87 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ARO7P32178 256 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DAL3P32459 195 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SPS19P32573 292 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRP4P32902 394 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SSS1P35179 80 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GPT2P36148 743 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ROT2P38138 954 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TOS1P38288 455 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ATG12P38316 186 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C AFG3P39925 761 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YEL025CP39991 1188 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C VAB2P40003 282 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YIL166CP40445 542 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C NEO1P40527 1151 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ERR3P42222 437 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ZIM17P42844 174 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CIT3P43635 486 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SSY5P47002 699 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GCV1P48015 400 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PAC10P48363 199 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GUP1P53154 560 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SCW11P53189 542 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YAF9P53930 226 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YDC1Q02896 317 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C IRC4Q03036 179 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TRS31Q03337 283 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SLD5Q03406 294 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MAK3Q03503 176 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CSM3Q04659 317 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C THI7Q05998 598 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YLR173WQ06247 608 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CUR1Q06469 252 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRL1Q06815 381 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YDL057WQ07379 328 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ESC8Q08119 714 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RRP40Q08285 240 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YOL159CQ08300 171 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CSM4Q08955 156 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C LAP2Q10740 671 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C AIM7Q12156 149 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PSF1Q12488 208 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C COA6Q3E846 104 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MYO1P08964 1928 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C STF1P01098 86 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FLP1P03870 423 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HIS5P07172 385 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ALG7P07286 448 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C URA6P15700 204 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ARG8P18544 423 aa3.34□□□□□ -1.87
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