RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W SKG1P36169 355 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ARA1P38115 344 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W FIG1P38224 298 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SIF2P38262 535 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TSC10P38342 320 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AIM18P38884 321 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ECM10P39987 644 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NAS2P40555 220 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HXT14P42833 540 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W IRC8P47046 822 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MRX6P48564 524 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YGR017WP53210 297 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RSM27P53305 110 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W COQ6P53318 479 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88not detected
VFA1YER128W YNL034WP53963 612 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YNL018CP53976 612 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SMA1Q02651 245 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CTF19Q02732 369 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YDC1Q02896 317 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ATC1Q04005 294 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CIA1Q05583 330 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MFG1Q07684 458 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W THI73Q07904 523 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W FEX2Q08991 375 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W APC9Q12107 265 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YOR214CQ12282 236 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W WIP1Q2V2P8 89 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa3.3□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YSP2Q06681 1438 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W URA3P03962 267 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RAD10P06838 210 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SPS4P09937 338 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MRP1P10662 321 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W UNG1P12887 359 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SAN1P22470 610 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RER1P25560 188 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NDC1P32500 655 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ECM25P32525 599 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PTC1P35182 281 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CLG1P35190 452 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ALY1P36117 915 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W UTP30P36144 274 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W APN2P38207 520 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YBR071WP38243 211 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HSL7P38274 827 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ICS2P38284 255 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SEC72P39742 193 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CHS6P40955 746 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SER2P42941 309 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W OTU1P43558 301 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CAF16P43569 289 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W FMP33P46998 180 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RTT101P47050 842 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W BIR1P47134 954 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W UFD1P53044 361 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W DIA1P54005 336 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NUP116Q02630 1113 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SKY1Q03656 742 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YDR248CQ03786 193 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ARA2Q04212 335 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CDC123Q05791 360 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YDR061WQ12298 539 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W DGK1Q12382 290 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ISA2Q12425 185 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W FMP16Q12497 93 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-ER2Q03619 1755 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-MR1Q04214 1755 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-NL1Q12112 1755 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-GR1Q12141 1755 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TY1B-BLQ12490 1755 aa3.29□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MF(ALPHA)1P01149 165 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HTB1P02293 131 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HTB2P02294 131 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SRD1P09007 221 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W URA6P15700 204 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AAC3P18238 307 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
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