RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 YME1L1Q96TA2 773 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 UPP2O95045 317 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 ST3GAL1Q11201 340 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 GPM6BQ13491 265 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR33A8MZF0 331 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 SART3Q15020 963 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPROQ16827 1216 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 STAM2O75886 525 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNA1P02708 482 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 LTBRP36941 435 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 RCAN1P53805 252 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 NEDD9Q14511 834 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 GNPTABQ3T906 1256 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC2Q9BYS8 371 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 FIBPO43427 364 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBRQ0VD83 1088 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAF1Q13077 416 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEB3A0JP26 581 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCP20941 246 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 ZP2Q05996 745 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEBQ6S5H4 581 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 NECAB1Q8N987 351 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 APBB2Q92870 758 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf67A6NJJ6 358 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD1O95696 1058 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MGAT3Q09327 533 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CTC1Q2NKJ3 1217 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 RPAINQ86UA6 219 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MEIS2O14770 477 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAT1P11488 350 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP4P98171 946 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SCRN1Q12765 414 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 NFKBIBQ15653 356 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PCNX4Q63HM2 1172 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ERICH2A1L162 156 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 LY9Q9HBG7 655 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC3P53804 2025 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3CDO00329 1044 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM6O15303 877 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP9AO75110 1047 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 GJB2P29033 226 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 LPIN1Q14693 890 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 NRCAMQ92823 1304 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 GHRP10912 638 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 WTAPQ15007 396 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 GBP4Q96PP9 640 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF3AQ9Y496 699 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ALADP13716 330 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNA2P16389 499 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNNB1P35222 781 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 BMPR1AP36894 532 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SP4Q02446 784 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 HYAL1Q12794 435 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH8Q5T0T0 291 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 FIBCD1Q8N539 461 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDND1Q9NY35 253 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 KAT6AQ92794 2004 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ENPP3O14638 875 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 DCXO43602 365 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK1Q14012 370 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.46■■□□□ 1.99
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