RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC181Q5TID7 509 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 IQCEQ6IPM2 695 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 DIO2Q92813 273 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRM-208ENST00000578600 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRM-208ENST00000578600 INF2Q27J81 1249 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRM-208ENST00000578600 WNK4Q96J92 1243 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRM-208ENST00000578600 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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PTPRM-208ENST00000578600 SPINK2P20155 84 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-208ENST00000578600 FSTL1Q12841 308 aa7.09□□□□□ -1.27
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