RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 CXCR5P32302 372 aa24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 GANQ9H2C0 597 aa24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 MED4Q9NPJ6 270 aa24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 CETN3O15182 167 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 BUB1O43683 1085 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HOXD13P35453 343 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SFR1Q86XK3 245 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 VAV3Q9UKW4 847 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 MSH4O15457 936 aa24.88■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 CIITAP33076 1130 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 LMAN1P49257 510 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 KCNH2Q12809 1159 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 FAM20AQ96MK3 541 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.88■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 BMP3P12645 472 aa24.87■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.87■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.87■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 EHD2Q9NZN4 543 aa24.87■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 PHACTR2O75167 634 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 A0A1W2PRG0 241 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 EPS15P42566 896 aa24.86■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D5Q92609 795 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.86■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 MYBP10242 640 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 CYP4A11Q02928 519 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SLC18A3Q16572 532 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 MYH10P35580 1976 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.85■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.85■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.85■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 A0A087X0T9 212 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 FAM228BP0C875 321 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 ACTN1P12814 892 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 NAB2Q15742 525 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 HINFPQ9BQA5 517 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 STK24Q9Y6E0 443 aa24.84■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 EML1O00423 815 aa24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 CYP3A4P08684 503 aa24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.83■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 ENTPD3O75355 529 aa24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 AOC3Q16853 763 aa24.83■■□□□ 1.57
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RCCD1-208ENST00000557266 RUBCNQ92622 972 aa24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RCCD1-208ENST00000557266 PDXKO00764 312 aa24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 RNF40O75150 1001 aa24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 PALMO75781 387 aa24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 KLRC1P26715 233 aa24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 STYK1Q6J9G0 422 aa24.82■■□□□ 1.56
RCCD1-208ENST00000557266 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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