RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441124.5

HDLBP-218, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-218ENST00000441124 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 NEK1Q96PY6 1258 aa21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 ZBTB5O15062 677 aa21.41■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 STAG3L1P0CL83 205 aa21.41■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 MARK3P27448 753 aa21.41■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.41■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 CACNA1AO00555 2505 aa21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 KLRF2D3W0D1 207 aa21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 IGBP1P78318 339 aa21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 SUSD6Q92537 303 aa21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.4■■□□□ 1.02
HDLBP-218ENST00000441124 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 FIBPO43427 364 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ID4P47928 161 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 NUBP1P53384 320 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SEMA3FQ13275 785 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 GRIK4Q16099 956 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.39■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SCG2P13521 617 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TECP42680 631 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.38■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 NBL1P41271 181 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 DUSP6Q16828 381 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PIGSQ96S52 555 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.37■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 M0QZ92 97 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 STAM2O75886 525 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 GLG1Q92896 1179 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 RILPL2Q969X0 211 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MTMR8Q96EF0 704 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 AAASQ9NRG9 546 aa21.36■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PLXNA3P51805 1871 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ERVFC1P60507 584 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TRAF1Q13077 416 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PAK2Q13177 524 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MTMR3Q13615 1198 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 IER5Q5VY09 327 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ADSSL1Q8N142 457 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TMEM260Q9NX78 707 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PADI3Q9ULW8 664 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.35■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 FSD2A1L4K1 749 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 FGF18O76093 207 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PDE1AP54750 535 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 UBE3AQ05086 875 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 APOBRQ0VD83 1088 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 S1PR5Q9H228 398 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 NR2E1Q9Y466 385 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 TTC3P53804 2025 aa21.34■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 BRD1O95696 1058 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 NT5C2P49902 561 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 NLRX1Q86UT6 975 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 CDH22Q9UJ99 828 aa21.33■■□□□ 1.01
HDLBP-218ENST00000441124 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.33■■□□□ 1.01
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