RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 RETREG2Q8NC44 543 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 AFAP1L1Q8TED9 768 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 HIPK3Q9H422 1215 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 NRCAMQ92823 1304 aa17.36■□□□□ 0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.35■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.35■□□□□ 0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 TTC38Q5R3I4 469 aa17.34■□□□□ 0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIF28PB7ZC32 967 aa17.33■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 HBP1O60381 514 aa17.33■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.33■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.33■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 GJA10Q969M2 543 aa17.32■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2C18P33260 490 aa17.31■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF484Q5JVG2 852 aa17.31■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 VAV3Q9UKW4 847 aa17.31■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP131Q9UPN4 1083 aa17.31■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 TREHO43280 583 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 CAND2O75155 1236 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52Z1P0C646 297 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMC5P62195 406 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 RBL2Q08999 1139 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 BECN1Q14457 450 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHA7Q15375 998 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM266Q2M3C6 531 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 COL1A2P08123 1366 aa17.29■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa17.29■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPC1 479 aa17.29■□□□□ 0.36
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