RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YDR089WP38966 869 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SCS2P40075 244 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PDR16P53860 351 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YLR460CP54007 376 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RHO4Q00246 291 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C VPS74Q06385 345 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ATG34Q12292 412 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ALG7P07286 448 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C GPI12P23797 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C DBR1P24309 405 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ERG8P24521 451 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C FES1P38260 290 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CEP3P40969 608 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C FMP32P43557 207 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MAD3P47074 515 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RNH70P53331 553 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C GOR1P53839 350 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TVP15Q03860 143 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PUN1Q06991 263 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MDM12Q92328 271 aa6.43□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C HTA2P04912 132 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C AAC3P18238 307 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RPB5P20434 215 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C HEM3P28789 327 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C EMP70P32802 667 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C VPS51P36116 164 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PZF1P39933 429 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ARB1P40024 610 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YEN1P40028 759 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PTR3P43606 678 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RPE1P46969 238 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C GTO1P48239 356 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YGR079WP53249 370 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ALG12P53730 551 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PFA5Q03289 374 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PLM2Q04383 521 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C STE23Q06010 1027 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C UAF30Q08747 228 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C BAG7Q12128 409 aa6.42□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TRP3P00937 484 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C DBP2P24783 546 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C STE14P32584 239 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CAT2P32796 670 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YBR032WP38223 100 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SAP30P38429 201 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data6.41□□□□□ -1.38not detected
SPE3YPR069C HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data6.41□□□□□ -1.38not detected
SPE3YPR069C CIN1P40987 1014 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SHR5P41912 237 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C UBP6P43593 499 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TPC1P53257 314 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YLR446WQ06204 433 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YLL007CQ07799 665 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C FDH1Q08911 376 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TAD3Q9URQ3 322 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C FLO9P39712 1322 aa6.41□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PBS2P08018 668 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PBN1P25580 416 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SSO1P32867 290 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C OAF3P36023 863 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C FRE2P36033 711 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SCO2P38072 301 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C APE4P38821 490 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C AIM2P39721 246 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MNN5P46982 586 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CDH1P53197 566 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YPL107WQ02873 248 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ATP25Q03153 612 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C GAS2Q06135 555 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C GMC2Q06201 188 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YLR413WQ06689 675 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RCN2Q12044 265 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YRM1Q12340 786 aa6.4□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C MRP13P12686 339 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C ERD1P16151 362 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C MCK1P21965 375 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C CWH43P25618 953 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C ATS1P31386 333 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C BZZ1P38822 633 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C AYR1P40471 297 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C XBP1P40489 647 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C SEC26P41810 973 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C PGU1P47180 361 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C RPM2Q02773 1202 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C FAR8Q05040 523 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C DCR2Q05924 578 aa6.39□□□□□ -1.39
SPE3YPR069C SEI1Q06058 285 aa6.39□□□□□ -1.39
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