RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	LOT6	Q07923	191 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MCA1	Q08601	432 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SFM1	Q12314	213 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	COR1	P07256	457 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	HOG1	P32485	435 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MRPL6	P32904	214 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RIM101	P33400	625 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MTG2	P38860	518 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MNL1	P38888	796 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YJL068C	P40363	299 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MPM1	P40364	252 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	LAS21	P40367	830 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YPS6	P40583	537 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	FAR7	P43592	221 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	HOC1	P47124	396 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MRPS28	P21771	286 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	NPR1	P22211	790 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	VPH2	P32341	215 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	PEP12	P32854	288 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	FAU1	P40099	211 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	LTP1	P40347	161 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MRPS18	P42847	217 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YGR201C	P42936	225 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SPO19	Q03029	223 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	MMT2	Q08970	484 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RIB3	Q99258	208 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	TIM9	O74700	87 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	CDC4	P07834	779 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	KSS1	P14681	368 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SLY41	P22215	453 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	UBC8	P28263	218 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	LOT5	P34234	306 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	HCS1	P34243	683 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	QDR2	P40474	542 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RHO4	Q00246	291 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SED5	Q01590	340 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YEH1	Q07804	573 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	BMT6	Q12291	365 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	SEC39	Q12745	709 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDR2	YOL052C-A	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	VPS33	P20795	691 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YPL107W	Q02873	248 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	STP3	Q05937	343 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SNF5	P18480	905 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	HOP1	P20050	605 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	PTP2	P29461	750 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YMC1	P32331	307 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MKK1	P32490	508 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YRO2	P38079	344 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YBR285W	P38354	144 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TDA11	P38854	504 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YAR028W	P39548	234 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YRB2	P40517	327 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ATG17	Q06410	417 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YLR030W	Q07967	263 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RKM5	Q12367	367 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TSC13	Q99190	310 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RPB5	P20434	215 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RER1	P25560	188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ARE1	P25628	610 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CWP1	P28319	239 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.25	□□□□□ -0.77	not detected
DDR2	YOL052C-A	NUF2	P33895	451 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SPC42	P36094	363 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	UTH1	P36135	365 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MPH1	P40562	993 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	STE24	P47154	453 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	IBA57	P47158	497 aa		10.25	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 144.5 ms