RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	BUD4	P47136	1447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PDE2	P06776	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MLH1	P38920	769 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	LAM5	P43560	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	IBD2	P53892	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	NSE1	Q07913	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RAD61	Q99359	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	ALG1	P16661	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	ITR1	P30605	584 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	POP2	P39008	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	BRO1	P48582	844 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	BET5	Q03630	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PPM1	Q04081	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SRL2	Q12020	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SPO12	P17123	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MIX23	P38162	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	IDP2	P41939	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PIB2	P53191	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	TIP41	Q12199	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	HIR3	P47171	1648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SPS22	P25380	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	KKQ8	P36004	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YBP1	P38315	674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	GPI16	P38875	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MMT1	Q03218	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	IMA2	Q08295	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	FRE6	Q12473	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MSP1	P28737	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MRP4	P32902	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	DAD2	P36162	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	NAT2	P37293	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PFF1	P38244	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	INM1	P38710	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	WSS1	P38838	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	FAA2	P39518	744 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PHB2	P50085	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	CDC21	P06785	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	CHS1	P08004	1131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	PHO91	P27514	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	AGA1	P32323	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MRPL4	P36517	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	RIB5	P38145	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YGL260W	P53056	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	WSC2	P53832	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	YFH1	Q07540	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	HNT3	Q08702	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLL017W	YLL017W	DST1	P07273	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	HEM15	P16622	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YLL017W	YLL017W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YBR056W	P38081	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	QDR3	P38227	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YSW1	P38280	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	PAC11	P40960	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	EPL1	P43572	832 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	ROG1	P53118	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	STD1	Q02794	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SRN2	Q99176	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	CDC25	P04821	1589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	LTE1	P07866	1435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RGT1	P32862	1170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	STP2	P38704	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RRF1	P38771	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YHR218W	P38899	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	CHS6	P40955	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	MEP2	P41948	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	NFI1	Q12216	726 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms