RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	AIM32	Q04689	311 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PEX10	Q05568	337 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	APC5	Q08683	685 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	UAF30	Q08747	228 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	UBX3	Q12229	455 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	BBP1	Q12365	385 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	TRM10	Q12400	293 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	COX5A	P00424	153 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	CDC9	P04819	755 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	HEM2	P05373	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RAD7	P06779	565 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PUT2	P07275	575 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	STE4	P18851	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PPZ1	P26570	692 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	GAC1	P28006	793 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PEX3	P28795	441 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SYN8	P31377	255 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	NTG1	P31378	399 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RIM4	P38741	713 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	FHL1	P39521	936 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SER33	P40510	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	GCD10	P41814	478 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PTR3	P43606	678 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	GLG2	P47011	380 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	KEL2	P50090	882 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	BOL2	P53082	120 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	COX18	P53239	316 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	IBD2	P53892	351 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SPP2	Q02521	185 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YML108W	Q03759	105 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	APC4	Q04601	652 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	BLS1	Q06071	122 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	CRN1	Q06440	651 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SWC7	Q06707	132 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	MDM36	Q06820	579 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	BUD7	Q08754	746 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	NBP2	Q12163	236 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	RIP-Chip
TVP38	YKR088C	JLP1	Q12358	412 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RIB3	Q99258	208 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ARG81	P05085	880 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	COS2	P0CX12	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	COS3	P0CX13	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RSR1	P13856	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	VPS33	P20795	691 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	HSP30	P25619	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YIH1	P25637	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PTC6	P25646	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SFP1	P32432	683 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	COX13	P32799	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SKT5	P34226	696 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	APL3	P38065	1025 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	RIB1	P38066	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	FMP23	P38231	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	STB5	P38699	743 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ARN2	P38724	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YLF2	P38746	405 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	MTG2	P38860	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	MTW1	P39731	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ESL1	P40456	1118 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	COS4	P43542	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	SNG1	P46950	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	HOC1	P47124	396 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YNL018C	P53976	612 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	ARP4	P80428	489 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	PET117	Q02771	107 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	NHP10	Q03435	203 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	TAF12	Q03761	539 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	FIN1	Q03898	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TVP38	YKR088C	BCH1	Q05029	724 aa		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.1 ms