RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	RFX1	P48743	811 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	LYS5	P50113	272 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MRPL50	P53724	139 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	OCA2	P53949	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	STD1	Q02794	444 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	USA1	Q03714	838 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	TAF12	Q03761	539 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PAM18	Q07914	168 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ALE1	Q08548	619 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MRPL8	P22353	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	KRE2	P27809	442 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	CIN8	P27895	1000 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PSO2	P30620	661 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	FRE1	P32791	686 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ALP1	P38971	573 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PLB1	P39105	664 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YER130C	P39959	443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YKL050C	YKL050C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YKL050C	YKL050C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ECM3	Q99252	613 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	UBR2	Q07963	1872 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	GAL4	P04386	881 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MAS1	P10507	462 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YSR3	P23501	404 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	HXT2	P23585	541 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YHR112C	P38716	378 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YAR1	P46683	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YJL118W	P47022	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ROG1	P53118	685 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ASI2	P53895	289 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ATG17	Q06410	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ARR3	Q06598	404 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	NCB2	Q92317	146 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RHB1	P25378	209 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	IMG1	P25626	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	REC114	P32841	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YHR210C	P38893	341 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	UIP3	P39547	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	IMO32	P53219	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SSY1	Q03770	852 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	GMC2	Q06201	188 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	TIP41	Q12199	356 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	INP53	Q12271	1107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	FAR1	P21268	830 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	APL1	P27351	700 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	DOA1	P36037	715 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RFC5	P38251	354 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	FHL1	P39521	936 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SPG5	P42933	373 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SWP82	P43554	623 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SAD1	P43589	448 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	RIP-Chip
YKL050C	YKL050C	FMP33	P46998	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	KAP114	P53067	1004 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YGR079W	P53249	370 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PEX27	Q08580	376 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SUT2	Q12286	268 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YLR415C	O13578	112 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	COX2	P00410	251 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	EMP70	P32802	667 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MMS21	P38632	267 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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