RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	THI7	Q05998	598 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PEX27	Q08580	376 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	BAG7	Q12128	409 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RRT12	P25381	491 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	CSM1	P25651	190 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
IKS1	YJL057C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	VPS51	P36116	164 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	STP2	P38704	541 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YJL163C	P46996	555 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MSY1	P48527	492 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	KAP114	P53067	1004 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YGL159W	P53110	370 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RNT1	Q02555	471 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	DCR2	Q05924	578 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	COX1	P00401	534 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	REV1	P12689	985 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SNF6	P18888	332 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MRPL8	P22353	238 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SIN4	P32259	974 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	TAF14	P35189	244 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	APD1	P38281	316 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MIC12	P38341	106 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SDH8	P38345	138 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPC97	P38863	823 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	UIP3	P39547	235 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YER121W	P40076	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ATG27	P46989	271 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NPA3	P47122	385 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	TAF6	P53040	516 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RRN9	P53437	365 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPO77	Q06134	477 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SYO1	Q07395	620 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MSH5	Q12175	901 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YVC1	Q12324	675 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NCB2	Q92317	146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YKL162C	P36052	402 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MRPL7	P36519	292 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ERG28	P40030	148 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ICE2	P40499	491 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GAB1	P41733	394 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
IKS1	YJL057C	MTL1	P53214	551 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MRPS35	P53292	345 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	VAC7	P53950	1165 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PRM15	Q03262	622 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	STE18	P18852	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPO26	P20435	155 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GIT1	P25346	518 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	BCS1	P32839	456 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AST1	P35183	429 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR262W	P38430	313 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ECM10	P39987	644 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YFR020W	P43600	232 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AMA1	P50082	593 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPT20	P50875	604 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	HST3	P53687	447 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RAD1	P06777	1100 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GAC1	P28006	793 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SPT10	P35208	640 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RSM25	P40496	264 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74

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